特許
J-GLOBAL ID：201603014117638342
位置特異的スコアの算出装置、算出方法及びプログラム、GPIアンカー修飾部位の特定装置、特定方法及びプログラム、並びにGPIアンカー修飾部位の判定装置、判定方法及びプログラム
発明者：
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出願人/特許権者：
代理人 (4件)：
志賀 正武
, 棚井 澄雄
, 高橋 詔男
, 五十嵐 光永
公報種別：特許公報
出願番号（国際出願番号）：特願2012-189907
公開番号（公開出願番号）：特開2014-048797
特許番号：特許第5991524号
出願日： 2012年08月30日
公開日（公表日）： 2014年03月17日
請求項（抜粋）：
【請求項1】 GPIアンカー型タンパク質のGPIアンカー修飾部位を基準位置としてN末端側及びC末端側に連続する所定の残基数の所定の領域の各残基位置におけるアミノ酸残基の種類の出現度合いを示す位置特異的スコアの算出装置であって、
複数のGPIアンカー型タンパク質のアミノ酸配列情報を取得する配列取得部と、
前記配列取得部が取得したアミノ酸配列情報のGPIアンカー修飾部位の残基位置を基準位置とする前記所定の領域内の位置に存在するアミノ酸残基の種類の出現頻度である正解出現頻度を算出する正解出現頻度算出部と、
前記配列取得部が取得したアミノ酸配列情報から、位置特異的スコアの算出に用いるGPIアンカー修飾部位以外のアミノ酸残基を抽出する不正解残基抽出部と、
前記不正解残基抽出部が抽出した複数のアミノ酸残基を用いて、当該アミノ酸残基を基準位置とする前記所定の領域内の位置に存在するアミノ酸残基の種類の出現頻度である不正解出現頻度を算出する不正解出現頻度算出部と、
アミノ酸残基の種類ごとに、前記正解出現頻度を前記不正解出現頻度で除算した値に基づいて位置特異的スコアを算出する位置特異的スコア算出部と
を備えることを特徴とする位置特異的スコアの算出装置。
IPC (1件)：
FI (1件)：
引用特許：
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