文献
J-GLOBAL ID:201702257093137289
整理番号:17A0903228
メタゲノム解析アプリケーションGHOSTZ-GPUの性能モデリングおよび改善
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著者 (3件):
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資料名:
巻:
2017
号:
HPC-160
ページ:
Vol.2017-HPC-160,No.21,1-4 (WEB ONLY)
発行年:
2017年07月19日
JST資料番号:
U0451A
資料種別:
会議録 (C)
記事区分:
原著論文
発行国:
日本 (JPN)
言語:
日本語 (JA)
抄録/ポイント:
抄録/ポイント
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メタゲノム解析とは微生物の分離を行わず,そのままDNAを読み...
シソーラス用語:
シソーラス用語/準シソーラス用語
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準シソーラス用語:
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分類 (3件):
分類
JSTが定めた文献の分類名称とコードです
分子・遺伝情報処理
, ディジタル計算機方式一般
, 専用演算制御装置
引用文献 (5件):
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Suzuki S, Kakuta M, Ishida T, Akiyama Y (2016) GPU-Acceleration of Sequence Homology Searches with Database Subsequence Clustering. PLoS ONE 11(8): e0157338. doi:10.1371/journal.pone.0157338
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Zhang Chaojie, Koichi Shirahata, Shuji Suzuki, Yutaka Akiyama, and Satoshi Matsuoka. ”Performance Analysis of MapReduce Implementations for High Performance Homology Search” In Proceedings of the HPCS 2015 (2015)
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Shuji Suzuki, Masanori Kakuta, Takashi Ishida, Yutaka Akiyama. Faster sequence homology searches by clustering subsequences. Bioinformatics (2014) 31 (8): 1183-1190. doi : 10.1093/bioinformatics/btu780
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Hoefler, Torsten and Gropp, William and Kramer, William and Snir, Marc. Performance modeling for systematic performance tuning. SC ’11 State of the Practice Reports (2011)
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CUDA Toolkit Documentation(online) 入手先 <http://docs.nvidia.com/cuda/profiler-usersguide/index.html> (2017.06.28).
タイトルに関連する用語 (4件):
タイトルに関連する用語
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