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J-GLOBAL ID：202202272542080177   整理番号：22A1847124

微生物叢のメタゲノム解析に有用なアセンブルツール:MetaPlatanus

著者 (2件)： 梶谷嶺 (東京工大) ,  伊藤武彦 (東京工大)
資料名： バイオサイエンスとインダストリー  (B & I)
巻： 80  号： 4  ページ： 328-329  発行年： 2022年07月10日 
JST資料番号： G0089A  ISSN： 0914-8981  CODEN： BIDSE6  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： ・新規開発したメタゲノムアセンブルツール「MetaPlata...

シソーラス用語： *マイクロバイオーム ,...
準シソーラス用語： DNAシークエンシング ,...

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分類 (3件)： 微生物検査法  (EG02020G) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

引用文献 (4件)：

• Kajitani, R. et al.: MetaPlatanus: a metagenome assembler that combines long-range sequence links and species-specific features, Nucleic Acids Res., 49(22), e130 (2021)
• Yahara, K. et al.: Long-read metagenomics using PromethION uncovers oral bacteriophages and their interaction with host bacteria, Nat. Commun., 12(1), 27 (2020)
• Kolmogorov, M. et al.: metaFlye: scalable long-read metagenome assembly using repeat graphs, Nat. Methods, 17 (11), 1103-1110 (2020)
• Bickhart, DM. et al.: Generating lineage-resolved, complete metagenome-assembled genomes from complex microbial communities, Nat. Biotechnol., doi: 10.1038/s41587-021-01130-z (2022)

タイトルに関連する用語 (3件)： 微生物叢 ,  メタゲノム解析 ,  ツール