- 2023 - 2027 環境変動に伴う森林の植生衰退が土壌レガシー効果を引き起こすメカニズムの解明
- 2022 - 2026 撹乱を受けた森林のレジリエンスに寄与する生物間相互作用・機能群を特定する
- 2021 - 2024 風力発電施設におけるコウモリ類衝突リスク低減に向けた情報・技術基盤形成
- 2019 - 2023 森林の急激な環境変化が野生植物の生態的・進化的変化に与える影響
- 2018 - 2023 マイクロバイオームに基づく森林環境の評価手法の開発
- 2019 - 2022 森林撹乱に伴う土壌の機能的コア微生物叢の改変が生態系修復に及ぼす影響の解明
- 2018 - 2021 微生物群集機能に基づく樹木の材腐朽進展プロセスの解明
- 2017 - 2020 進化的トレードオフ・環境応答を考慮して非損傷個体からの萌芽発生の重要性を解明する
- 2016 - 2019 シカ食害による森林植生と土壌微生物相の機能的変化がリター分解に及ぼす影響の解明
- 2013 - 2017 葉食性昆虫の大発生に強い健全な森林生態系に関する研究
- 2011 - 2016 養菌性キクイムシが媒介する樹木萎凋病の国際的なリスク評価に必要な基礎データの収集
- 2012 - 2015 農林生態系における天敵多様性の生態系機能
- 2012 - 2014 GenBankデータに基づく全球スケールでの微生物多様性分布の解明
- 2012 - 2014 多目的最適化アルゴリズムを用いた自然保護区の空間配置分析ツールの開発
- 2011 - 2014 樹木との共進化を考慮した植食性昆虫群集の多様性形成機構の解明
- 2010 - 2014 環北方域の針葉樹林の衰退機構と適応的森林資源管理
- 2009 - 2011 群集形成に伴う生態系機能の発現:微生物マイクロコズム実験による保険仮説の検証
- 2007 - 2009 生物多様性の中立説の動物群集への拡張に関する研究
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