吉沢明康

ヨシザワアキヤス | YOSHIZAWA Akiyasu C.

所属機関・部署：
職名：特任准教授

研究分野 (3件)：生命、健康、医療情報学 , システムゲノム科学 , 生物物理学

研究キーワード (7件)：バイオインフォマティクス(計算生物学) , データベース , プロテオミクス , 比較ゲノム , 質量分析 , メタボロミクス , 生体膜

競争的資金等の研究課題 (18件)：

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論文 (33件)：

Liu Y, Yoshizawa AC, Ling Y, Okuda S. Insights into predicting small molecule retention times in liquid chromatography using deep learning. Journal of Cheminformatics. 2024. 16. 113
Watanabe Y, Yoshizawa AC, Ishihama Y, Okuda S. The jPOST Repository as a Public Data Repository for Shotgun Proteomics. Methods in Molecular Biology. 2021. 2259. 309-322
Oka M, Xu L, Suzuki T, Yoshikawa T, Sakamoto H, Uemura H, Yoshizawa AC, Suzuki Y, Nakatsura T, Ishihama Y, et al. Aberrant splicing isoforms detected by full-length transcriptome sequencing as transcripts of potential neoantigens in non-small cell lung cancer. Genome Biology. 2021. 22. 9
Yamamoto H, Hayakawa E, Tsugawa H, Moriya Y, Fukusaki E, Goto S, Hasunuma T, Miura N, Yoshizawa AC. Japan Computational Mass Spectrometry Meeting 2020 Activity Report. Journal of Proteome Data and Methods. 2020. 2. 5
Tabata T, Yoshizawa AC, Ishihama Y. jPOST Tools (I): Utilities for Peak List Processing. Journal of Proteome Data and Methods. 2020. 2. 4

MISC (40件)：

Tabata T, Yoshizawa AC, Ogata K, Chang C, Araki N, Sugiyama N, Ishihama Y. UniScore, a unified and universal measure for peptide identification by multiple search engines. BioRχiv. 2024. 2024.10.09.617445
守屋勇樹, 吉沢明康. 第3回質量分析インフォマティクス・ハッカソン(質量分析インフォマティクス研究会)〔地域部会・公募研究会の活動報告〕. 日本バイオインフォマティクス学会ニュースレター. 2020. 37. 18-19
守屋勇樹, 吉沢明康. 質量分析インフォマティクス研究会〔地域部会・公募研究会の活動報告〕. 日本バイオインフォマティクス学会ニュースレター. 2019. 36. 13-14
吉沢明康, 田畑剛, 岩崎未央, 杉山直幸, Kaell Lukas, 石濱泰. 事後ペプチドシーケンスタグの利用によるタンパク質同定の精度向上. 電気泳動. 2019. 63. Suppl. 245-245
早川英介, 守屋勇樹, 山本博之, 吉沢明康. 質量分析インフォマティクス研究会〔地域部会・公募研究会の活動報告〕. 日本バイオインフォマティクス学会ニュースレター. 2019. 35. 14-15

特許 (13件)：

書籍 (4件)：

講演・口頭発表等 (222件)：

大規模言語モデルを用いたタンパク質代謝回転予測
(第97回日本生化学会大会 2024)
プロテオーム統合データベースjPOSTとデータジャーナルJPDM
(第97回日本生化学会大会 2024)
MB-POST: A novel data repository for storing high-quality spectral data in metabolomics mass spectrometry
(第97回日本生化学会大会 2024)
Mass spectrometry data repositories facilitate the multi-omics experimental data accumulation and reanalysis
(APBJC 2024 (Asia & Pacific Bioinformatics Joint Conference 2024) 2024)
From JPDM to jPOST:データ論文を用いたデータ再解析の半自動化
(トーゴーの日シンポジウム2024 2024)

Works (7件)：

Mass++ ver.4
Tanaka, S, Murase, M, Kato, M, Yamamoto, H, Matsubara, M, Tabata, T, Kusano, M, Kawano, S, Okuda, S, Yoshizawa, AC 2018 - 現在
jPOST(repoitory (jPOSTrepo), database (jPOSTdb), 再解析)
Okuda, S, Yoshizawa,AC, Kobayashi,D, Takahashi,Y, Watanabe,Y, Moriya,Y, Hatano,A, Takami,T, Matsumoto,M, Araki,N, Tabata,T, Iwasaki,M, Sugiyama,N, Kodera,Y, Tanaka,S, Goto,S, Kawano,S, Ishihama,Y 2016 - 現在
Mass++ ver.2.7.4/2.7.5
Tanaka, S, Fujita,Y, Parry, H.E, Yoshizawa, AC, Morimoto, K, Murase, M, Yamada, Y, Yao, J, Utsunomiya, S, Kajihara, S, Fukuda, M, Ikawa, M, Tabata, T, Takahashi, K, Aoshima, K, Nihei, Y, Nishioka, T, Oda, Y, Tanaka, K 2014 - 現在
KEGG OC
Nakaya, A, Katayama, T, Itoh, M, Hiranuka, K, Kawashima, S, Moriya, Y, Okuda, S, Tanaka, M, Tokimatsu, T, Yamanishi, Y, Yoshizawa, AC, Kanehisa, M, Goto, S 2012 - 現在
CIPRO (Ciona intestinalis Protein Database)
Endo, T, Ueno, K, Yonezawa, K, Mineta, K, Hotta, K, Satou, Y, Yamada, L, Ogasawara, M, Takahashi, H, Nakajima, A, Nakachi, M, Nomura, M, Yaguchi, J, Sasakura, Y, Yamasaki, C, Sera, M, Yoshizawa, AC, Imanishi, T, Taniguchi, H, Inaba, K 2009 - 現在

学歴 (4件)：

学位 (1件)：

経歴 (15件)：

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所属学会 (6件)：

日本生化学会 , American Society for Mass Spectrometry (ASMS) , Human Proteome Organization (HUPO) , 日本プロテオーム学会 (JPrOS/JHUPO) , 日本分子生物学会 , 日本生物物理学会

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吉沢 明康