- 2023 - 2027 津波被災地の海岸防災施設における環境保全事業の多面的評価
- 2023 - 2026 攪乱と安定環境が駆動する塩性湿地植物の時空間遺伝構造の解明
- 2021 - 2024 植物プランクトン-共生細菌の相互作用を利用した湖沼水質管理手法の検討
- 2018 - 2021 湖沼で神経毒を生産するラン藻類のモニタリングと制御に向けたゲノム基盤研究
- 2017 - 2019 湖沼深水層に特有の微生物ループの解明
- 2017 - 2019 塩生湿地植物における東日本大震災後の景観遺伝学的解析と保全策の検討
- 2015 - 2018 強塩基性・高アルカリ度な巨大閉鎖性塩湖、トルコ・ワン湖の特徴的陸水科学過程
- 2014 - 2016 1細胞計測系を用いたシアノバクテリアにおける窒素固定と毒生産の表現型可塑性解析
- 2013 - 2016 神経毒生産ラン藻Cuspidothrixの生態と分子系統地理学的研究
- 2006 - 2008 河川連続体と不連続結合の概念に基づいた貯水池の環境影響評価
- 2003 - 2004 ダム建設と運用による河川の水温異常とその生物影響
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