ベッカーゲルトヤン

Bekker Gert-Jan

所属機関・部署：
職名：講師

研究分野 (3件)：生命、健康、医療情報学 , 計算科学 , 生物物理学

論文 (37件)：

Nobutaka Numoto, Fumiya Kondo, Gert-Jan Bekker, Zengwei Liao, Mitsuaki Yamashita, Akira Iida, Nobutoshi Ito, Narutoshi Kamiya, Masayuki Oda. Structural dynamics of the Ca2+-regulated cutinase towards structure-based improvement of PET degradation activity. International Journal of Biological Macromolecules. 2024. 281. 136597-136597
Mitsugu Araki, Toru Ekimoto, Kazuhiro Takemura, Shigeyuki Matsumoto, Yunoshin Tamura, Hironori Kokubo, Gert-Jan Bekker, Tsutomu Yamane, Yuta Isaka, Yukari Sagae, et al. Molecular Dynamics Unveils Multiple-Site Binding of Inhibitors with Reduced Activity on the Surface of Dihydrofolate Reductase. Journal of the American Chemical Society. 2024
Chioko Nagao, Hiroko Okuda, Gert-Jan Bekker, Atsuko Noguchi, Tsutomu Takahashi, Akio Koizumi, Shohab Youssefian, Tohru Tezuka, Shinji Akioka. Familial Episodic Pain Syndrome: A Japanese Family Harboring the Novel Variant c.2431C>T (p.Leu811Phe) in SCN11A. Biochemical Genetics. 2024
Gert-Jan Bekker, Kanji Oshima, Mitsugu Araki, Yasushi Okuno, Narutoshi Kamiya. Binding Mechanism between Platelet Glycoprotein and Cyclic Peptide Elucidated by McMD-Based Dynamic Docking. Journal of Chemical Information and Modeling. 2024. 64. 10. 4158-4167
Gert-Jan Bekker, Yoshifumi Fukunishi, Junichi Higo, Narutoshi Kamiya. Binding Mechanism of Riboswitch to Natural Ligand Elucidated by McMD-Based Dynamic Docking Simulations. ACS Omega. 2024

MISC (32件)：

三宅智哉, 西村和樹, 松田佳央理, 藤田純三, 藤田純三, 藤田純三, 難波啓一, 難波啓一, 徳山健斗, 戸谷吉博, et al. 大腸菌由来ホスホエノールピルビン酸カルボキシラーゼ変異体の構造機能. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2023. 46th
BEKKER Gert-Jan. PDBjが提供する,構造データを分析,編集・登録するためのツールやサービス. 日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集. 2021. 21st
BEKKER Gert-Jan. 構造データの解析と可視化のためのPDBjツールとサービス. 生物物理(Web). 2021. 61. Supplement 1-2
横地政志, BEKKER Gert-Jan, 栗栖源嗣. RDFグラフデータモデルによるwwPDBコアアーカイブの拡張. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2021. 44th
Narutoshi Kamiya, Gert-Jan Bekker. Flexible Docking between Enzyme and Its Inhibitor Using Multicanonical MD Simulations and Binding Free Energy Calculations. BIOPHYSICAL JOURNAL. 2020. 118. 3. 361A-361A

書籍 (2件)：

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