研究者
J-GLOBAL ID:201801006737971186   更新日: 2019年12月30日

島村 徹平

シマムラ テッペイ | SHIMAMURA Teppei
所属機関・部署:
職名: 教授
研究分野 (2件): システムゲノム科学 ,  生命・健康・医療情報学
研究キーワード (8件): 一細胞解析 ,  マルチオミクス ,  遺伝子ネットワーク ,  オミクス ,  次世代シークエンサー ,  システム生物学 ,  バイオインフォマティクス ,  統計科学
競争的資金等の研究課題 (8件):
  • 2019 - 2021 精神疾患の階層横断的理解を加速する数理モデリング技術の開発
  • 2018 - 2020 生命現象の階層横断的な理解を可能する統計的モデリング技術の開発
  • 2015 - 2020 スーパーコンピューティングと革新的情報技術によるがんシステムの新次元探索
  • 2015 - 2019 細胞内代謝シフトを解析、統合、理解するためのベイズモデリング
  • 2016 - 2018 低pH腫瘍微小環境による悪性化機構の解明
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論文 (74件):
  • Abe K, Minoura K, Maeda Y, Nishikawa H, Shimamura T. Model-based clustering for flow and mass cytometry data with clinical information. BMC Systems Biology. in press. 2020
  • Minoura K, Abe K, Maeda Y, Nishikawa H, Shimamura T. Model-based cell clustering and population tracking for time-series flow cytometry data. BMC Bioinformatics. in press. 2019. 20. Suppl 23. 633
  • Osawa T, Shimamura T, Saito K, Hasegawa Y, Ishii N, Nishida M, Ando R, Kondo A, Anwar M, Tsuchida R, Hino S, Sakamoto A, Igarashi K, Saitoh K, Kato K, Endo K, Yamano S, Kanki Y, Matsumura Y, Minami T, Tanaka T, Anai M, Wada Y, Wanibuchi H, Hayashi M, Hamada A, Yoshida M, Yachida S, Nakao M, Sakai J, Aburatani H, Shibuya M, Hanada K, Miyano S, Soga T, Kodama T. Phosphoethanolamine Accumulation Protects Cancer Cells under Glutamine Starvation through Downregulation of PCYT2. Cell reports. 2019. 29. 1. 89-103.e7
  • Kajino T, Shimamura T, Gong S, Yanagisawa K, Ida L, Nakatochi M, Griesing S, Shimada Y, Kano K, Suzuki M, Miyano S, Takahashi T. Divergent lncRNA MYMLR regulates MYC by eliciting DNA looping and promoter-enhancer interaction. The EMBO journal. 2019. 38. 17. e98441
  • Matsuno Y, Atsumi Y, Shimizu A, Katayama K, Fujimori H, Hyodo M, Minakawa Y, Nakatsu Y, Kaneko S, Hamamoto R, Shimamura T, Miyano S, Tsuzuki T, Hanaoka F, Yoshioka KI. Replication stress triggers microsatellite destabilization and hypermutation leading to clonal expansion in vitro. Nature communications. 2019. 10. 1. 3925
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学歴 (3件):
  • 1998 - 2002 北海道大学 工学部
  • 2002 - 2004 北海道大学 大学院工学研究科 情報工学専攻修士課程
  • 2004 - 2007 北海道大学 大学院情報科学研究科 複合情報学専攻博士後期課程
学位 (1件):
  • 博士(情報科学) (北海道大学)
経歴 (6件):
  • 2006/04 - 2007/03 日本学術振興会 特別研究員
  • 2007/04 - 2010/03 東京大学医科学研究所 特任研究員
  • 2010/04 - 2011/08 東京大学医科学研究所 特任助教
  • 2011/08 - 2014/03 東京大学医科学研究所 助教
  • 2014/04 - 2019/05 名古屋大学大学院医学系研究科 特任准教授
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受賞 (3件):
  • 2016/03 - 文部科学省委託事業 スキルと実践を重視したビッグデータ・イノベーション人材育成ビッグデータチャレンジ賞
  • 2016/03 - 日本計算機統計学会 平成28年度データ解析コンペティションID-POS部門最優秀賞
  • 2011/12 - 日本バイオインフォマティクス学会 Japanese Society for Bioinformatics Prize Winners
所属学会 (4件):
日本癌学会 ,  日本分子生物学会 ,  日本バイオインフォマティクス学会 ,  日本計算機統計学会
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