- 2020 - 2023 高山地域のジオダイバーシティが生物多様性創出に果たす役割
- 2017 - 2021 琵琶湖における珪藻の大型化とその背景となった湖水深変動の解明
- 2017 - 2020 高山池沼を核とする生物多様性の形成とジオダイバーシティ
- 2016 - 2019 元素分析による身元不明遺体の出身地域推定の検討
- 2016 - 2019 異なる時代や地域の標本とシミュレーションを複合させた国際河川環境教育
- 2014 - 2017 北海道北部の白亜系から得られた日本最古の珪藻化石群集の研究
- 2011 - 2015 北陸と九州から大量出土した縄文時代早・前期人骨の形態・DNA・食性分析
- 2009 - 2014 年縞堆積物による環太平洋諸文明の高精度環境史復元
- 2011 - 2013 種分化過程における浮遊珪藻形態変遷の高時間分解能復元
- 2009 - 2011 年縞堆積物に挟在される重力流の流動・堆積モデルと規制要因の研究
- 2006 - 2010 年縞の分析による年単位の環境史復元と稲作漁労文明の興亡
- 2003 - 2005 第三紀の日本海拡大にともなう古環境変動と珪藻の適応戦略
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