研究者
J-GLOBAL ID：200901005100638096   更新日: 2024年11月16日

西山 真

ニシヤマ マコト | Nishiyama Makoto
所属機関・部署：
東京大学 大学院 農学生命科学研究科 附属アグロバイオテクノロジー研究センター 細胞機能工学研究部門

東京大学 大学院 農学生命科学研究科 附属アグロバイオテクノロジー研究センター 細胞機能工学研究部門 について


職名： 教授
ホームページURL (2件)： http://park.itc.u-tokyo.ac.jp/cbt/ ,  http://park.itc.u-tokyo.ac.jp/cbt/en/
研究分野 (2件)： 応用生物化学 ,  応用微生物学
研究キーワード (2件)： 応用微生物学・応用生物化学 ,  Applied Microbiology and Applied Biochemistry
競争的資金等の研究課題 (29件)：
  • 2022 - 2025 放線菌の二次代謝産物の生合成における新機能酵素の探索とその分子機構
  • 2010 - 2020 Studies on enzymes creating natural product diversity
  • 2017 - 2018 リジン及び関連代謝酵素群の構造・機能と分子進化機構の解明
  • 2017 - アミノ基キャリアタンパク質を介する生合成機構の解明と二次代謝産物構造多様性の拡張
  • 2014 - 2016 高度好熱菌のタンパク質アシル化修飾による代謝制御機構に関する研究
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論文 (243件)：
  • Teruhito Kato, Dan Xia, Taro Ozaki, Tomoyo Nakao, Ping Zhao, Makoto Nishiyama, Taro Shiraishi, Tomohisa Kuzuyama. In vivo and in vitro reconstitution of biosynthesis of N-prenylated phenazines revealing diverse phenazine-modifying enzymes. Chembiochem : a European journal of chemical biology. 2024. e202400723
  • Yusuke Ito, Daisuke Yoshidome, Makoto Hidaka, Yasuko Araki, Kotaro Ito, Saori Kosono, Makoto Nishiyama. Improvement of the nitrogenase activity in Escherichia coli that expresses the nitrogen fixation-related genes from Azotobacter vinelandii. Biochemical and Biophysical Research Communications. 2024. 728. 150345-150345
  • Daisuke Yoshidome, Makoto Hidaka, Toka Miyanaga, Yusuke Ito, Saori Kosono, Makoto Nishiyama. Glutamate production from aerial nitrogen using the nitrogen-fixing bacterium Klebsiella oxytoca. Communications Biology. 2024. 7. 1
  • Genki Hibi, Taro Shiraishi, Tatsuki Umemura, Kenji Nemoto, Yusuke Ogura, Makoto Nishiyama, Tomohisa Kuzuyama. Discovery of type II polyketide synthase-like enzymes for the biosynthesis of cispentacin. Nature Communications. 2023. 14. 1
  • Ryuhei Nagata, Makoto Nishiyama, Tomohisa Kuzuyama. Substrate Recognition Mechanism of a Trichostatin A-Forming Hydroxyamidotransferase. Biochemistry. 2023
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MISC (52件)：
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特許 (4件)：
書籍 (4件)：
  • Design of hydrophobic core of ┣DBE. coli(/)-┫DB malate dehydrogenase based on the side-chain packing
    Pacific symposium on biocomputing '97 1997
  • Site-directed mutagenesis revealed role of subsite residues of ┣DBMucor(/)-┫DB ┣DBpusillus(/)-┫DB popsin in catahytic function
    Asportic Proteinases: Structure, Function, Biology, and Biomedical Implications.(K. Takahashi ed.) Plenum Press, N.Y. 1995
  • Tyrosine 75 on the flap contributes to enhance catalytic efficiency of a fungal aspartic proteinase, ┣DBMucor(/)-┫DB ┣DBpusillus(/)-┫DB pepsin
    Aspartic Proteinases: Structure, Function, Biology, and Biomedical Implications (K.Takahashi ed.))Plenum-Press N.Y. 1995
  • A yeast expression system and site-directed mutagenesis of a fungal aspartic proreinage, ┣DBMucor(/)-┫DB rennin
    Structure and Functon of the Aspartic Proteinases(B. M. Dunn, ed. )Plenum Press, New York 1991
講演・口頭発表等 (13件)：
  • シクロラバンデュリル二リン酸合成酵素の結晶構造解析
    (日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2017)
  • シクロラバンデュリル2リン酸合成酵素の結晶構造解析
    (イソプレノイド研究会例会講演要旨集 2016)
  • 放線菌由来ジテルペン環化酵素CotB2が触媒する精巧な環化反応機構の解明
    (日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2016)
  • Corynebacterium glutamicum由来ホスホエノールピルビン酸カルボキシラーゼ(PEPC)のアセチル化制御はグルタミン酸生産に重要である
    (日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2016)
  • 放線菌由来ジテルペン環化酵素CotB2の特異な環化反応機構の解明
    (イソプレノイド研究会例会講演要旨集 2015)
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Works (4件)：
  • アスパラギン的プロテアーゼの構造と機能
    1994 - 2000
  • 耐熱性酵素の蛋白工学的研究
    1994 - 2000
  • Structure and function of aspaitic proteineses
    1994 - 2000
  • Protein engineering of thermostable enzymes
    1994 - 2000
学歴 (3件)：
  • - 1988 東京大学 大学院 農学系研究科 農芸化学専門課程博士課程
  • - 1986 東京大学 大学院 農学系研究科 農芸化学専門課程修士課程
  • - 1984 東京大学 農学部 農芸化学
学位 (1件)：
  • 博士(農学) (東京大学)
経歴 (6件)：
  • 2003 - 現在 東京大学 教授
  • 1994 - 2003 東京大学 助教授
  • 1988 - 1994 東京大学 助手
  • Professor
  • Associate Professor
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委員歴 (33件)：
  • 2023/07 - 現在 国立研究開発法人 科学技術振興機構 戦略的創造研究推進事業 先端的カーボンニュートラル技術開発(ALCA-Next)グリーンバイオテクノロジー領域 領域アドバイザー
  • 2023/05 - 現在 公益社団法人 日本農芸化学会 理事(会長)
  • 2022/04 - 現在 国立学校法人 大阪大学 蛋白質研究所運営協議会委員
  • 2021/06 - 現在 日本微生物学連盟 理事・監事
  • 2021 - 現在 公益財団法人 野田産業科学研究所 評議員
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受賞 (2件)：
  • 2023/03 - 公益社団法人 日本農芸化学会 日本農芸化学会賞 アミノ基キャリアタンパク質を介したリジン等天然化合物の新規生合成システムに関する研究
  • 1993/03 - 社団法人 日本農芸化学会 農芸化学奨励賞 部位特異的による有用酵素・蛋白の改良と構造-機能相関の解析
所属学会 (6件)：
アメリカ微生物学会 ,  アメリカ生化学分子生物学会 ,  日本放線菌学会 ,  日本ビタミン学会 ,  日本生化学会 ,  日本農芸化学会
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