- 2022 - 2027 バハレーン・ティロス文化の古墳に葬られた集団の特性と構成に関する総合的研究
- 2024 - 2026 受傷人骨の骨科学分析による縄文終末期の埋葬原理と社会変容の解明
- 2022 - 2026 受傷人骨の骨科学分析による縄文終末期の埋葬原理と社会変容の解明
- 2018 - 2023 古代人ゲノム配列解析にもとづくヤポネシア人進化の解明
- 2018 - 2023 ゲノム配列を核としたヤポネシア人の起源と成立の解明
- 2018 - 2021 狩猟採集文化と農耕文化の接触による社会の変容と地域的多様性に関する学際的研究
- 2016 - 2021 Out of Africa:ホモ・サピエンスのアジア拡散モデルの再構築
- 2016 - 2018 浜北旧石器時代人骨出土地の再調査
- 2016 - 2018 琉球列島にあった太古の海洋渡航技術を検証する総合的研究
- 2015 - 2018 次世代シークエンサーを用いた古代病原菌解析法の開発
- 2013 - 2018 中国先史狩猟民埋葬遺跡の発掘調査 -ユーラシア東部の人類史解明に向けて-
- 2013 - 2018 全ゲノム解析法を用いた縄文人と渡来系弥生人の関係の解明
- 2014 - 2016 縄文時代前期人骨の核ゲノム解析による縄文人集団の遺伝的変遷の解明
- 2012 - 2016 地下式横穴墓から出土した人骨および人骨関連遺物に関する骨考古学的研究
- 2011 - 2016 古代パルミラの葬制の変化と社会的背景にかかわる総合的研究
- 2011 - 2016 東南アジア・オセアニアにおける現生人類の拡散移住史
- 2011 - 2015 北陸と九州から大量出土した縄文時代早・前期人骨の形態・DNA・食性分析
- 2011 - 2013 島嶼地域における洞穴遺跡の基礎的研究
- 2010 - 2012 形態と遺伝子から解明する近世アイヌ集団の起源と成立史
- 2008 - 2012 徳川将軍親族遺体のデジタル保存と考古学的・人類学的分析-大奥の実態に迫る-
- 2008 - 2011 日本列島と大陸との人の交流に関する人類学的研究
- 2008 - 2010 南西諸島先史時代人の成立ちを探る-形質に見られる地域変異の解明を目指して
- 2008 - 2010 東南アジア人の二層構造の解明:ベトナム・マンバック遺跡からの人類学的アプローチ
- 2008 - 2010 古代パルミラの葬制の変化とその社会的背景にかかわる総合的研究
- 2007 - 2010 島嶼地域における先史時代墓制の系譜
- 2007 - 2010 古代アンデス社会におけるヒトの移動と文化変容の関係の解明
- 2007 - 2009 種子島における古人骨形質の時代変化
- 2005 - 2009 更新世から縄文・弥生期にかけての日本人の変遷に関する総合的研究
- 2005 - 2008 古代パルミラの葬制の変化と社会的背景にかかわる総合的研究
- 2007 - 2007 中世鎌倉人骨のDNAデータベース作成
- 2005 - 2007 沖縄県具志川市具志川グスク崖下地区の発堀調査
- 2006 - 2006 中世鎌倉人骨のDNAデータベース作成
- 2003 - 2006 中国・中原地域出土の古人骨に関する人類学的研究:渡来系弥生人の起源を巡って
- 2004 - 2005 生化学的分析によってミイラからどのような情報が抽出できるのか
- 2004 - 2005 中世人骨由来のDNAデータベースの作成とその集団遺伝学的研究
- 2003 - 2005 中国大陸南部における新石器時代人の起源についての人類学的・考古学的研究
- 2003 - 2005 古代人の脳と人骨のDNA解析および形態解析に関する研究
- 2001 - 2004 先インカ〜インカ帝国形成期におけるアンデス先住民の人類学的研究
- 1999 - 2001 ミトコンドリアDNAの塩基配列から見た縄文人と弥生人の関係
- 2000 - 2000 北部九州出土の弥生時代早期人骨のミトコンドリアDNA分析
- 1999 - 2000 中国江南地方出土の古人骨に関する人類学的研究-渡来系弥生人の起源を巡って-
- 1997 - 1999 中妻貝塚出土の多数合葬人骨からみた親族関係と縄文社会の研究
- 1997 - 1999 古人骨のミトコンドリアDNA分析に基づく弥生人とその社会
- 1996 - 1998 渡来系弥生人の中国江南起源に関する人類学的研究
- 1996 - 1996 ミトコンドリアDNAの塩基配列から見た現代九州日本人
- 1995 - 1995 南米ペル-先インカ期時代人の分子生物学的解析
- 1994 - 1994 北部九州弥生人のミトコンドリアDNAの変異パターンとその系統
- 1991 - 1991 PCR法を用いた弥生人集団のDNAの解析
- 縦断的成長研究
- 古人骨由来のDNAの解析
- Longitudinal growth Study
- Analysis of DNA from ancient human bones
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