研究者
J-GLOBAL ID：200901020603956094   更新日: 2024年11月07日

中村 昇太

ナカムラ ショウタ | Nakamura Shota
所属機関・部署：
大阪大学 微生物病研究所

大阪大学 微生物病研究所 について


職名： 准教授
研究分野 (5件)： ゲノム生物学 ,  構造生物化学 ,  細菌学 ,  感染症内科学 ,  衛生学、公衆衛生学分野:実験系を含む
研究キーワード (5件)： ゲノム解析 ,  メタゲノム解析 ,  バイオインフォマティクス ,  構造生物学 ,  微生物叢解析
競争的資金等の研究課題 (22件)：
  • 2023 - 2026 腸内細菌叢によるアンドロゲンシグナル経路を介した去勢抵抗性前立腺癌進展機序の解明
  • 2022 - 2026 遺伝的素因、生活習慣、腸内細菌叢の多面的解析に基づく前立腺癌の早期診断戦略の構築
  • 2020 - 2023 インドネシアに流行する抗酸菌のゲノム疫学研究
  • 2020 - 2023 病原微生物のその場メタゲノミックタイピング手法の研究開発
  • 2017 - 2020 ベトナムにおけるコリスチン耐性細菌蔓延実態の分子疫学的調査研究
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論文 (321件)：
  • Kazunobu Asao, Noriyasu Hashida, Kazuichi Maruyama, Daisuke Motooka, Shota Nakamura, Kohji Nishida. Cases of endophthalmitis caused by Candida albicans and Candida dubliniensis identified via internal transcribed spacer deep sequencing. BMC ophthalmology. 2024. 24. 1. 444-444
  • Kiyoharu Fukushima, Yuki Matsumoto, Yuko Abe, Kazuki Hashimoto, Daisuke Motooka, Seigo Kitada, Haruko Saito, Sho Komukai, Eriko Fukui, Takayuki Niitsu, et al. Variability of macrolide-resistant profile in Mycobacterium avium complex pulmonary disease. Antimicrobial agents and chemotherapy. 2024. e0121324
  • Jayedul Hassan, Atsushi Hinenoya, Noritoshi Hatanaka, Sharda Prasad Awasthi, Goutham Belagula Manjunath, Nahid Rahman, Jyoji Yamate, Shota Nakamura, Daisuke Motooka, Akira Nagita, et al. A plasmid-mediated type III secretion system associated with invasiveness and diarrheagenicity of Providencia rustigianii. mBio. 2024. e0229724
  • Hiroya Oki, Ryotaro Niwa, Somboonthum Pranee, Daisuke Motooka, Yoshiyuki Onda, Jun Nakata, Hiroko Nakajima, Yoshihiro Oka, Haruo Sugiyama, Yuka Yoshii, et al. Identification of causative fungus from sterile abscess using metagenomics followed by in situ hybridization. Access microbiology. 2024. 6. 8
  • Fumiaki Ihara, Hisako Kyan, Yasuhiro Takashima, Fumiko Ono, Kei Hayashi, Tomohide Matsuo, Makoto Igarashi, Yoshifumi Nishikawa, Kenji Hikosaka, Hirokazu Sakamoto, et al. Far-East Asian Toxoplasma isolates share ancestry with North and South/Central American recombinant lineages. Nature communications. 2024. 15. 1. 4278-4278
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MISC (63件)：
  • 吉田 志緒美, 露口 一成, 青野 昭男, 五十嵐 ゆり子, 松本 悠希, 中村 昇太, 能田 淳, 御手洗 聡, 井上 義一, 竹本 潔, et al. 重症心身障害児施設におけるM.abscessus subsp.massilienseの院内感染事例. 結核. 2023. 98. 4. 118-118
  • 元岡大祐, 前田悠一, 前田悠一, 沖大也, 田中健太郎, 猪頭英里, 平田晴彦, 木田博, 熊ノ郷淳, 中村昇太, et al. 新型コロナウイルス感染症の重症度に応じた腸内細菌叢とマイコバイオータの長期的変化. 日本細菌学雑誌(Web). 2023. 78. 1
  • 岡田紘一, 竹澤健太郎, 小山佳久, 元岡大祐, 中村昇太, 辻村剛, 今中岳洋, 栗林宗平, 福原慎一郎, 木内寛, et al. 前立腺腫大は前立腺細菌叢と関連するか:前立腺細菌叢のプロファイリング. 日本排尿機能学会誌(Web). 2022. 33. 1. 208-208
  • 清水健太郎, 平田陽彦, 徳平夏子, 上田安希子, 元岡大祐, 中村昇太, 小倉裕司. 新型コロナウイルス感染症(COVID-19)に伴う難治性大量下痢症の1例. 日本救急医学会雑誌. 2022. 33. 1
  • 安部祐子, 安部祐子, 福島清春, 福島清春, 福島清春, 松本悠希, 新津敬之, 新津敬之, 新居卓朗, 木庭太郎, et al. リアルタイムコアゲノム解析による非結核性抗酸菌症の迅速・高精度同定法の確立および臨床応用. 日本サルコイドーシス/肉芽腫性疾患学会雑誌. 2021. 41
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書籍 (8件)：
  • 非結核性抗酸菌症の血清診断について
    "Insmed合同会社 第95回日本感染症学会学術講演会 第69回日本化学療法学会総会 記録集" 2021
  • 次世代シーケンス技術の現状と今後-2020
    公益社団法人 日本生物工学会 2021
  • Structual basis of type IVb pilus-mediated bacterial adhesion to the intestinal epithelium
    Spring-8 SACLA Research Frontiers 2019
  • 抗生物質の「先」の薬を目指す
    神戸新聞総合出版センター 2018 ISBN:9784343010018
  • ウイルス検出のためのNGS解析のデザインと運用
    PHARM TECH JAPAN 2018
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講演・口頭発表等 (110件)：
  • Current Diagnostic Approach of Non-tuberculous Mycobacteria
    (インドネシア大学医学部 交流会 2023)
  • メタゲノム解析による環境微生物探索
    (第151 回関西実験動物研究会 2023)
  • Automated Analysis Pipeline for Nanopore Sequencing ー Identification of Non-Tuberculous Mycobacteria
    (National Institute of Cholera and Enteric Diseases (NICED) Seminar 2023)
  • 非結核性抗酸菌の迅速その場同定
    (第6回抗酸菌研究会 2022)
  • 腸内細菌がIVb型線毛システム依存的に分泌するタンパク質の特徴
    (第45回分子生物学会 2022)
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学歴 (3件)：
  • - 2006 大阪大学 大学院薬学研究科 分子薬科学専攻 博士後期課程修了
  • - 2003 大阪大学 大学院薬学研究科 分子薬化学専攻 博士前期課程修了
  • - 2001 広島大学 理学部 化学科 卒業
経歴 (4件)：
  • 2023/01 - 現在 大阪大学 微生物病研究所 遺伝情報実験センター 感染症メタゲノム研究分野 准教授
  • 2016/04 - 2022/12 大阪大学微生物病研究所 感染症国際研究センター 病原体同定研究グループ 特任准教授(常勤)
  • 2011 - 2016 大阪大学微生物病研究所 遺伝情報実験センター ゲノム情報解析分野 助教
  • 2006 - 2011 大阪大学微生物病研究所 日本・タイ感染症共同研究センター バイオインフォマティクス部門 特任助教(常勤)
受賞 (3件)：
  • 2023/10 - 日本微生物学連盟 2023年度 野本賞 カテゴリー「病気と健康」
  • 2020/09 - 科学技術振興機構及び新エネルギー産業技術総合開発機構 大学発ベンチャー表彰2020 文部科学大臣賞 次世代シーケンシングによる腸内細菌DNAの迅速解析法の確立
  • 2014/07 - 大阪大学 大阪大学総長奨励賞
所属学会 (5件)：
日本結晶学会 ,  日本結核・非結核性抗酸菌症学会 ,  日本分子生物学会 ,  日本ウイルス学会 ,  日本細菌学会
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