研究者
J-GLOBAL ID:200901027788600325   更新日: 2024年06月25日

清水 透

Shimizu Toru
所属機関・部署:
職名: Visiting Professor
その他の所属(所属・部署名・職名) (2件):
  • Shantou University Medical College  Visiting Professor
  • 国立研究開発法人 産業技術総合研究所 東北センター  外来研究員
ホームページURL (1件): http://db.tohoku.ac.jp/whois/detail/ea1ef4b248c8b94cd805054c0eae90c4.html
研究分野 (3件): 無機・錯体化学 ,  生物物理学 ,  機能生物化学
研究キーワード (6件): 無機生物化学 ,  タンパク質構造 ,  ヘムタンパク質 ,  Inorganic biochemistry ,  Protein structure ,  Heme proteins
競争的資金等の研究課題 (2件):
  • 1976 - 1976 金属酵素の構造ー機能相関関係
  • 1976 - 1976 Structure and function relationships of metallo enzymes
論文 (68件):
  • Jakub Vabra, Autor Segunin, Petr Jerabek, Toru Shimizu, Marketa Martinkova. Signal transduction mechanisms in heme-based global-coupled oxygen sensors with a focus on a histidine kinase (AfGcHK) and a diguanylate cyclase (YddV or EcDosC). Biological Chemistry. 2022
  • Toru Shimizu. Disruption of the dimerization interface of the sensing domain in the dimeric heme-based oxygen sensor AfGcHK abolishes bacterial signal transduction. Journal of Biological Chemistry. 2020
  • Toru Shimizu, Alzbeta Lengalova, Václav Martínek, Markéta Martínková. Heme: emergent roles of heme in signal transduction, functional regulation and as catalytic centres. Chemical Society Reviews. 2019
  • Martin Stranava, Petr Man, Tereza Skalova, Petr Kolenko, Jan Blaha, Veronika Fojtikova, Vaclav Martinek, Jan Dohnalek, Alzbeta Lengalova, Michal Rosulek, et al. Coordination and redox state-dependent structural changes of the heme-based oxygen sensor AfGcHK associated with intraprotein signal transduction. JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY. 2017. 292. 51. 20921-20935
  • Martin Stranava, Vaclav Martinek, Petr Man, Veronika Fojtikova, Daniel Kavan, Ondrej Vanek, Toru Shimizu, Marketa Martinkova. Structural characterization of the heme-based oxygen sensor, AfGcHK, its interactions with the cognate response regulator, and their combined mechanism of action in a bacterial two-component signaling system. PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS. 2016. 84. 10. 1375-1389
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MISC (261件):
書籍 (8件):
  • 酵素利用技術体系ー基礎・解析から改変・高機能化・産業利用までー
    エヌ・ティー・エス 2010
  • Handbook of Porphyrin Science
    World Science 2010
  • 酵素利用技術体系ー基礎・解析から改変・高機能化・産業利用までー
    エヌ・ティー・エス 2010
  • Handbook of Porphyrin Science
    World Science 2010
  • P450の分子生物学 第2版
    講談社 2009
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講演・口頭発表等 (8件):
  • NO activation of a heme-regulated kinase: A paradigm for PAS protein intereactions with NO?
    (Gordon Research Conference, Nitric Oxide 2005)
  • NO activation of a heme-regulated kinase: A paradigm for PAS protein intereactions with NO?
    (Gordon Research Conference, Nitric Oxide 2005)
  • Structure and Function Relationships of a Heme-regulated Phosphodiesterase from Escherichia coli (Ec DOS)
    (The 1st Pacific-Rim International Conference on Protein Science, Japan 2004)
  • Molecular mechanisms for the regulation of NO formation in neuronal nitric-oxide synthase
    (The 3rd International Conference on the Biology, Chemistry and Therapeutic Applications of Nitric Oxide 2004)
  • Structure and Function Relationships of Heme-regulated Enzymes
    (3rd Symposium on Advances in Bioinorganic Chemistry and 2nd Asian Biological Inorganic Chemistry Conference 2004)
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Works (6件):
  • イギリス生化学会誌 Biochemical Journal 編集委員
    2005 -
  • Editorial Advisory Panel for Biochemical Journal
    2005 -
  • NO合成酵素の活性発現におけるプテリンの役割
    2001 - 2004
  • NO合成酵素の活性発現におけるプテリンの役割
    2001 - 2004
  • アメリカ生化学・分子生物学会誌編集委員
    2001 -
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学歴 (3件):
  • - 1976 東北大学
  • - 1970 東北大学 理学部 化学科卒業
  • - 1970 東北大学
学位 (1件):
  • 理学博士 (東北大学)
経歴 (8件):
  • 2012/04 - 現在 東北大学 東北大学名誉教授
  • 1994/04 - 2012/03 東北大学 多元物質科学研究所 有機・生命科学研究部門 生体高分子化学研究分野 教授
  • 1988 - 1994 東北大学反応化学研究所 助教授
  • 1994 - - 東北大学多元物質科学研究所 教授
  • 1981 - 1988 東北大学非水溶液化学研究所 助手
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受賞 (1件):
  • 1992 - 日本化学会学術賞
所属学会 (14件):
THE NEW YORK ACADEMY OF SCIENCES ,  日本生物物理学会 ,  日本化学会 ,  American Association for the Advancement of Science ,  日本生化学会 ,  American Chemical Society ,  American Society for Biochemisty and Molecular Biology ,  THE NEW YORK ACADEMY OF SCIENCES ,  日本生物物理学会 ,  日本化学会 ,  American Association for the Advancement of Science ,  日本生化学会 ,  American Chemical Society ,  American Society for Biochemisty and Molecular Biology
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