大浪修一

オオナミシュウイチ | Onami Shuichi

所属機関・部署：
職名：チームリーダー
その他の所属（所属・部署名・職名） (6件)：

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ホームページURL (2件)： http://www.riken.jp/research/labs/bdr/dev_dyn/ , http://www.riken.jp/en/research/labs/bdr/dev_dyn/

研究分野 (3件)：生命、健康、医療情報学 , システムゲノム科学 , 生物物理学

競争的資金等の研究課題 (8件)：

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論文 (71件)：

Soya Shinkai, Shuichi Onami, Tomoshige Miyaguchi. Generalized Langevin dynamics for single beads in linear elastic networks. Physical Review E. 2024. 110. 4
Yuki Yamagata, Tsubasa Fukuyama, Shuichi Onami, Hiroshi Masuya. Prototyping an Ontological Framework for Cellular Senescence Mechanisms: A Homeostasis Imbalance Perspective. Scientific Data. 2024
Taro Ichimura, Taishi Kakizuka, Yuki Sato, Keiko Itano, Kaoru Seiriki, Hitoshi Hashimoto, Hiroya Itoga, Shuichi Onami, Takeharu Nagai. Volumetric trans-scale imaging of massive quantity of heterogeneous cell populations in centimeter-wide tissue and embryo. 2024
Bajcsy, Peter, Bhattiprolu, Sreenivas, Boerner, Katy, Cimini, Beth A., Collinson, Lucy, Ellenberg, Jan, Fiolka, Reto, Giger, Maryellen, Goscinski, Wojtek, Hartley, Matthew, et al. Enabling Global Image Data Sharing in the Life Sciences. arXiv. 2024
Bialy, Nikki, Alber, Frank, Andrews, Brenda, Angelo, Michael, Beliveau, Brian, Bintu, Lacramioara, Boettiger, Alistair, Boehm, Ulrike, Brown, Claire M.., Maina, Mahmoud Bukar., et al. Harmonizing the Generation and Pre-publication Stewardship of FAIR Image Data. arXiv. 2024

MISC (54件)：

大浪修一. バイオイメージングのデータ形式の標準とデータ共有システムの整備. 実験医学. 2021. 39. 19. 3007-3012
京田耕司, ホーケネス, 糸賀裕弥, 遠里由佳子, 大浪修一. 生命現象の時空間動態情報の可視化 (特集生物学のデータと可視化). 可視化情報学会誌 = Journal of the Visualization Society of Japan. 2020. 40. 156. 図巻頭1p,25-28
Soya Shinkai, Shuichi Onami, Ryuichiro Nakato. Toward understanding the dynamic state of 3D genome. Computational and structural biotechnology journal. 2020. 18. 2259-2269
大浪修一. 生細胞イメージング画像の画像解析. 実験医学. 2018. 36. 20. 213-214
大浪修一. 画像から情報を数値化し生命現象を捉える線虫で受精カルシウム波を引き起こす仕組みを解明. 広報誌RIKEN. 2017. 2017. 36-37

書籍 (12件)：

マウス初期胚全細胞ライブイメージングの達成 In 実験医学別冊最強のステップUPシリーズライトシート顕微鏡実践ガイド組織透明化&ライブイメージング
羊土社 2023 ISBN:9784758122689
ライトシート顕微鏡データのとり扱いと共有 In 実験医学別冊最強のステップUPシリーズライトシート顕微鏡実践ガイド組織透明化&ライブイメージング
羊土社 2023 ISBN:9784758122689
空間オミクス解析スタートアップ実践ガイド : 最新機器の特徴と目的に合った選び方、データ解析と応用例を学び、シングルセル解析の一歩その先へ!
羊土社 2023 ISBN:9784758122610
バイオ画像解析手とり足とりガイドバイオイメージと定量データのデータベース.
羊土社 2014 ISBN:9784758108157
生命のビッグデータ利用の最前線バイオイメージ・インフォマティクスが切り開く新しい生命科学の可能性
シーエムシー出版 2014 ISBN:9784781305370

講演・口頭発表等 (298件)：

Polymer physics of Hi-C data reveals linear viscoelasticity of the 3D genome
(RIKEN International Symposium on Nuclear Structure and Function 2024 2024)
SSBD: Global sharing of bioimaging data
(RIKEN BDR Symposium 2024 "Time Across Scales: Development, Homeostasis and Aging" 2024)
ELEPHANT: an image analysis tool for 2D/3D cell tracking using incrementally trainable deep learning
(RIKEN BDR Symposium 2024 "Time Across Scales: Development, Homeostasis and Aging" 2024)
Eggshell functions in C. elegans embryonic development
(RIKEN BDR Symposium 2024 "Time Across Scales: Development, Homeostasis and Aging" 2024)
Theory of viscoelasticity of chromatin and its surrounding environment
(RIKEN BDR Symposium 2024 "Time Across Scales: Development, Homeostasis and Aging" 2024)

学歴 (2件)：

学位 (1件)：

経歴 (17件)：

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受賞 (2件)：

2023/07 - 一般社団法人人工知能学会 2023年度人工知能学会全国大会(第37回)全国大会優秀賞老化制御を目指した細胞老化オントロジーモデリング
2021/07 - 一般社団法人人工知能学会 2021年度人工知能学会全国大会(第35回)全国大会優秀賞生命科学領域知識基盤構築に向けたオントロジー開発とCOVID-19機序解明に向けた取り組み

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