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J-GLOBAL ID：200902220520696468   整理番号：08A0395695

PCR-DGGE法による土壌生物群集解析法(1)一般細菌・糸状菌相の解析

著者 (2件)： 森本晶 (農業環境技術研) ,  星野(高田)裕子 (農業環境技術研)
資料名： 土と微生物  (Soil Microorganisms)
巻： 62  号： 1  ページ： 63-68  発行年： 2008年04月01日 
JST資料番号： L1734A  ISSN： 0912-2184  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： 土壌微生物群集のプロファイリング手法としてPCR-DGGE法が急速に普及している。本稿では一般細菌相,糸状菌相を対象としたPCR-DGGE法の具体的な手順を,土壌試料の調整,DNA抽出,PCR,DGGEの順に説明した。この実験条件は農林水産省のプロジェクト研究「土壌微生物相の解明による土壌生物性の解析技術の開発」のデータベースに登録するDGGEプロファイルの標準条件として用いられる。

シソーラス用語： PCR法 ,  *ゲル電気泳動 ,  土壌生物 ,  細菌 ,  糸状菌類 ,  マイクロバイオーム ,  行政機関 ,  *土壌微生物 ,  *PCR-DGGE法 ,  農林水産省 ,  微生物

分類 (1件)： 土壌生物  (FB04050N)

引用文献 (16件)：

• HEUER, H. Analysis of actinomycete communities by specific amplification of genes encoding 16S rRNA and gel-electrophoretic separation in denaturing gradients. Appl. Environ. Microbiol. 1997, 63, 3233-3241
• 星野(高田)裕子. 土壌からのDNA抽出法. 環境バイオテクノロジー学会誌. 2005, 5, 43-53
• 星野(高田)裕子. スキムミルクを用いた黒ボク土からのDNA抽出法. 農業環境研究成果情報. 2003, 19, 34-35
• 石井浩介. 微生物生態学への変性剤濃度勾配ゲル電気泳動法の応用. Microb. and Environ. 2000, 15, 59-73
• JIANG, J. Development of procedures for direct extraction of Cryptosporidium DNA from water concentrates and for relief of PCR inhibitors. Appl. Environ. Microbiol. 2005, 71, 1135-1141

タイトルに関連する用語 (7件)： PCR-DGGE法 ,  土壌生物 ,  群集 ,  解析法 ,  一般細菌 ,  糸状菌 ,  解析