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J-GLOBAL ID：200902224765982852   整理番号：08A1239819

日本水田の作土盤層における鉄斑中の細菌群衆

Bacterial communities in iron mottles in the plow pan layer in a Japanese rice field: Estimation using PCR-DGGE and sequencing analyses

著者 (7件)： CAHYANI Vita Ratri (Nagoya Univ., Nagoya) ,  CAHYANI Vita Ratri (Sebelas Maret Univ., Surakarta, IDN) ,  MURASE Jun (Nagoya Univ., Nagoya) ,  IKEDA Akihiro (Aichi-ken Agricultural Res. Center, Aichigun, JPN) ,  TAKI Katsutoshi (Aichi-ken Agricultural Res. Center, Aichigun, JPN) ,  ASAKAWA Susumu (Nagoya Univ., Nagoya) ,  KIMURA Makoto (Nagoya Univ., Nagoya)
資料名： Soil Science and Plant Nutrition  (Soil Science and Plant Nutrition)
巻： 54  号： 5  ページ： 711-717  発行年： 2008年10月 
JST資料番号： W1879A  ISSN： 0038-0768  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： PCR-DGGEおよび配列決定を用いて,水田の作土盤層における鉄斑中に生息する細菌群衆を調べた。Fe斑形成は薄膜状であり,Fe沖積層に比べて作土盤層に濃縮しているため,作土盤層を選んだ。水田の作土盤層の鉄斑に生息する細菌群衆は,作土盤層における対照区に比べて系統発生上異なっていた。近接種が,Feの酸化と還元を行う種々のタイプの細菌が,Fe斑に生息することを提案した。鉄斑に生息する細菌と同じDGGEバンドをもつ細菌は,Siderooxidans,Azoarcus,Azovibrio,Dechloromonasなどを含む10属であった。

シソーラス用語： 作土 ,  盤層 ,  水田 ,  *土壌細菌 ,  鉄 ,  PCR法 ,  ゲル電気泳動 ,  ヌクレオチド配列 ,  酸化還元反応 ,  細菌 ,  PCR-DGGE法 ,  アゾアルカス属 ,  微生物
準シソーラス用語： PCR-DGGE ,  Azoarcus

分類 (1件)： 土壌生物  (FB04050N)

引用文献 (28件)：

• ANDERS, H-J. Taxonomic positions of aromatic-degrading denitrifying pseudomonad strains K 172 and KB 740 and their description as new members of the genera Thauera, as Thauera aromatica sp. nov. and Azoarcus, as Azoarcus evansii sp. nov., respectively, members of Beta subclass of the Proteobacteria. Int. J. Syst. Bact. 1995, 45, 327-333
• BENZ, M. Anaerobic and aerobic oxidation of ferrous iron at neutral pH by chemoheterotrophic nitrate-reducing bacteria. Arch. Microbiol. 1998, 169, 159-165
• CAHYANI, VR. Succession and phylogenetic composition of bacterial communities responsible for the composting process of rice straw estimated by PCR-DGGE analysis. Soil Sci. Plant Nutr. 2003, 49, 619-630
• CAHYANI, VR. Bacterial communities in manganese nodules in rice field subsoils : Estimation by PCR-DGGE and sequencing analyses. Soil Sci. Plant Nutr. 2007, 53, 575-584
• CLARK, DA. Acidimicrobium ferrooxidans gen. nov., sp. nov. : mixed-culture ferrous iron oxidation with Sulfobacillus species. Microbiology. 1996, 142, 785-790

タイトルに関連する用語 (7件)： 日本 ,  水田 ,  作土 ,  盤層 ,  鉄 ,  斑 ,  細菌