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J-GLOBAL ID：200902231100312348   整理番号：08A1036292

小脳開発のトランスクリプトームデータベース(CDT-DB):マウスの小脳の出産後発育中の空間-時間遺伝子表現のプロファイリング

Cerebellar development transcriptome database (CDT-DB): Profiling of spatio-temporal gene expression during the postnatal development of mouse cerebellum

著者 (12件)： SATO Akira (Lab. of Molecular Neurogenesis, RIKEN Brain Sci. Inst., Wako, Saitama 351-0198, JPN) ,  SATO Akira (Synthetic Biology Team, RIKEN Advanced Sci. Inst., Yokohama 230-0045, JPN) ,  SEKINE Yukiko (Lab. of Molecular Neurogenesis, RIKEN Brain Sci. Inst., Wako, Saitama 351-0198, JPN) ,  SARUTA Chihiro (Lab. of Molecular Neurogenesis, RIKEN Brain Sci. Inst., Wako, Saitama 351-0198, JPN) ,  NISHIBE Hirozumi (Lab. of Molecular Neurogenesis, RIKEN Brain Sci. Inst., Wako, Saitama 351-0198, JPN) ,  MORITA Noriyuki (Lab. of Molecular Neurogenesis, RIKEN Brain Sci. Inst., Wako, Saitama 351-0198, JPN) ,  MORITA Noriyuki (Mimasaka Junior Coll., Tsuyama, Okayama 708-8511, JPN) ,  SATO Yumi (Lab. of Molecular Neurogenesis, RIKEN Brain Sci. Inst., Wako, Saitama 351-0198, JPN) ,  SADAKATA Tetsushi (Lab. of Molecular Neurogenesis, RIKEN Brain Sci. Inst., Wako, Saitama 351-0198, JPN) ,  SHINODA Yo (Lab. of Molecular Neurogenesis, RIKEN Brain Sci. Inst., Wako, Saitama 351-0198, JPN) ,  KOJIMA Toshio (Synthetic Biology Team, RIKEN Advanced Sci. Inst., Yokohama 230-0045, JPN) ,  FURUICHI Teiichi (Lab. of Molecular Neurogenesis, RIKEN Brain Sci. Inst., Wako, Saitama 351-0198, JPN)
資料名： Neural Networks  (Neural Networks)
巻： 21  号： 8  ページ： 1056-1069  発行年： 2008年10月
JST資料番号： T0698A  ISSN： 0893-6080  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 脳の発育および作用に対しては大量の遺伝情報が投入されている。マウス小脳の神経回路は誕生後3週間以内に全ての一連の細胞および形態学事象(ニューロンの増殖および移動,軸索樹上突起間シナプス,樹上突起の形成,シナプス形成,髄鞘形成を含む)を通して発育する。ゲノムの中にその時間的および空間的表現プロファイルが符号化されているはずの特定の遺伝子グループによりこれら事象の全てのコントロールされる。小脳回路発育の背景にある遺伝的基礎を理解するために,ゲノム全般での基礎の上での発育段階中の遺伝子表現(トランスクリプトーム)の解析を行った。空間(細胞および部位)解像度に対しては,in situハイブリッド化を用い,時間(発育時系列)解像度に対しては蛍光差分ディスプレイ,GeneChip,マイクロアレイ,RT-PCRを用いた収集を行い,遺伝子オントロジー(遺伝子および遺伝子プロダクトに対する制限付き用語)および解剖学的コンテキスト(小脳細胞型および回路構造)を用いてアノテーションを行った。各種のバイオインフォマティックスデータベースwebサイトでの関連情報に向けたシームレスなリンクを用いて,小脳発育トランスクリプトームデータベース(CDT-DB http://www.cdtdb.brain.riken.jpという知識リソースデータベースの中にアノテーション済み実験データを統合した。このCDT-DBではマウスの脳の発達における遺伝子表現に関する空間および時間パターン情報の両者をマイニングするためのユニークな情報学ツールを提供するだけでなく,小脳発育のためのトランスクリプトームの解明のための機会も開いている。Copyright 2008 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： *トランスクリプトーム ,  mRNA ,  遺伝子発現 ,  マウス ,  小脳 ,  データベース ,  成長 ,  遺伝子 ,  表現 ,  ゲノム ,  符号化 ,  原位置試験 ,  *データマイニング ,  情報科学 ,  生物学
準シソーラス用語： in situ試験 ,  バイオインフォマティクス ,  遺伝子表現 ,  発育

分類 (4件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  人工知能  (JE08000Z) ,  神経系一般  (EJ12010J)

タイトルに関連する用語 (12件)： 小脳 ,  開発 ,  トランスクリプトーム ,  データベース ,  CDT ,  Db ,  マウス ,  出産 ,  発育 ,  遺伝子 ,  表現 ,  プロファイリング