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J-GLOBAL ID：200902248314811520   整理番号：08A1040838

哺乳類概日時計の高振幅シスエレメントの解析と合成

Analysis and synthesis of high-amplitude Cis-elements in the mammalian circadian clock

著者 (12件)： KUMAKI Yuichi (RIKEN, Kobe, JPN) ,  KUMAKI Yuichi (INTEC Systems Inst., Inc., Tokyo, JPN) ,  UKAI-TADENUMA Maki (RIKEN, Kobe, JPN) ,  UNO Ken-ichiro D. (RIKEN, Kobe, JPN) ,  NISHIO Junko (RIKEN, Kobe, JPN) ,  MASUMOTO Koh-hei (RIKEN, Kobe, JPN) ,  MASUMOTO Koh-hei (Kinki Univ. School of Medicine, Osaka, JPN) ,  NAGANO Mamoru (Kinki Univ. School of Medicine, Osaka, JPN) ,  KOMORI Takashi (INTEC Systems Inst., Inc., Tokyo, JPN) ,  SHIGEYOSHI Yasufumi (Kinki Univ. School of Medicine, Osaka, JPN) ,  HOGENESCH John B. (Univ. Pennsylvania School of Medicine, PA) ,  UEDA Hiroki R. (RIKEN, Kobe, JPN)
資料名： Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  (Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America)
巻： 105  号： 39  ページ： 14946-14951  発行年： 2008年09月30日 
JST資料番号： D0387A  ISSN： 0027-8424  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 哺乳類の概日時計のオシレーターの動的な転写調節をシステムレベルで理解するために,Clock/Bmal1結合エレメント,DBP/E4BP4結合エレメント,RevErbA/ROR結合エレメントを伴うコンピューターモデルの哺乳類プロモーター/エンハンサーデータベースを作成し,時計の新しい標的を予測し,細胞や生物レベルで標的を検証するため用いた。自然にはない合成調節エレメントを作成し,このモデル上で試したところ,高振幅の概日遺伝子調節が起こった。生化学実験により,トランス活性化因子とトランス抑制因子の親和性のバランスが高振幅の概日遺伝子出力に重要であることを明らかになった。

シソーラス用語： 哺乳類 ,  *体内時計 ,  コンピュータ ,  *遺伝的調節 ,  プロモーター領域 ,  エンハンサー領域 ,  データベース ,  ターゲット ,  予測技法 ,  *ヌクレオチド配列 ,  DNA結合タンパク質 ,  ウイルスタンパク質 ,  転写因子
準シソーラス用語： *シス作用要素 ,  トランス活性化因子

分類 (2件)： 細胞構成体一般  (EF03010Z) ,  細胞生理一般  (EF02010S)

タイトルに関連する用語 (5件)： 哺乳類 ,  概日時計 ,  振幅 ,  シスエレメント ,  解析