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J-GLOBAL ID：200902262904304120   整理番号：08A0395696

PCR-DGGE法による土壌生物群集解析法(2)土壌線虫相の解析

著者 (2件)： 大場広輔 (農業環境技術研) ,  岡田浩明 (農業環境技術研)
資料名： 土と微生物  (Soil Microorganisms)
巻： 62  号： 1  ページ： 69-73  発行年： 2008年04月01日 
JST資料番号： L1734A  ISSN： 0912-2184  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： 線虫は食性が多岐にわたる,環境適応が種によって多様であるなどの理由から土壌中の線虫相を環境指標として用いようという研究が進められている。本稿ではこの線虫群集の解析手法としてPCR-DGGE法を,土壌試料の取扱い,土壌からの線虫分離およびサンプルの前処理,DNAの抽出と精製,PCR,DGGE,バンドの切り出し,個体からのDNA抽出の順に説明した。

シソーラス用語： PCR法 ,  *ゲル電気泳動 ,  土壌生物 ,  円虫類 ,  指数 ,  指標 ,  ミクロフローラ ,  *土壌線虫
準シソーラス用語： *PCR-DGGE法 ,  環境指標 ,  線虫

分類 (1件)： 土壌生物  (FB04050N)

引用文献 (18件)：

• BHADURY, P. Molecular detection of marine nematodes from environmental samples : overcoming eukaryotic interference. Aquatic Microbial Ecol. 2006, 44, 97-103
• BLAXTER, M. A molecular evolutionary framework for the phylum Nematoda. Nature. 1998, 392, 71-75
• COOK, A. Denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) as a tool for identification of marine nematodes. Mar. Ecol. Prog. Ser. 2005, 291, 103-113
• FLOYD, R. Molecular barcodes for soil nematode identification. Mol. Ecol. 2002, 11, 839-850
• FLOYD, RM. Nematode-specific PCR primers for the 18S small subunit rRNA gene. Mol. Ecol. Notes. 2005, 5, 611-612

タイトルに関連する用語 (6件)： PCR-DGGE法 ,  土壌生物 ,  群集 ,  解析法 ,  土壌線虫 ,  解析