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J-GLOBAL ID：200902265226234581   整理番号：09A0556225

DNAの部分的トポグラフィーはヒトゲノムの機能的非コード領域と関連している

Local DNA Topography Correlates with Functional Noncoding Regions of the Human Genome

著者 (6件)： PARKER Stephen C.J. (Boston Univ., MA, USA) ,  HANSEN Loren (Boston Univ., MA, USA) ,  HANSEN Loren (National Inst. Health, MD, USA) ,  ABAAN Hatice Ozel (National Inst. Health, MD, USA) ,  TULLIUS Thomas D. (Boston Univ., MA, USA) ,  MARGULIES Elliott H. (National Inst. Health, MD, USA)
資料名： Science  (Science)
巻： 324  号： 5925  ページ： 389-392  発行年： 2009年04月17日 
JST資料番号： E0078A  ISSN： 0036-8075  CODEN： SCIEA  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： DNAの溶媒接触可能表面積を調べるため水酸基ラジカル切断パターンを用いて,多種間のDNAトポロジー類似性に基づく拘束を測定するアルゴリズムを開発した。このアルゴリズムからヒトゲノムにおける塩基の12%が進化的に拘束されていることを見出したが,それはヌクレオチド配列に基づくアルゴリズムにより検出される数の二倍であった。トポグラフィーから分かった拘束領域はエンハンサーを含む機能的非コードエレメントと関連しており,単にヌクレオチド配列に基づいて同定された領域よりも良く関連していた。これらの結果,DNAの分子形は選択を受けており,進化の歴史を辿るものであるとの考えを支持した。

シソーラス用語： *DNA【核酸】 ,  *位相幾何学 ,  遺伝的アルゴリズム ,  ヌクレオチド配列 ,  エンハンサー領域 ,  mRNA ,  塩基対置換 ,  表現型
準シソーラス用語： *トポロジー ,  非コード領域 ,  選択圧

分類 (1件)： 核酸一般  (EB04010U)

タイトルに関連する用語 (4件)： DNA ,  トポグラフィー ,  ヒトゲノム ,  非コード領域