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J-GLOBAL ID：200902273543930707   整理番号：07A0080155

ナノ秒のMDシミュレーションから求めたペプチド二次構造の確率予測-三角マップ表示した%スティッキネス法の有用性

Stochastic Prediction of Peptide Secondary Structure Based on Molecular Dynamics Simulation Performed for Nano-second-Effectiveness of the %stickiness Approach Represented by Triangle Map Mode.

著者 (5件)： 村山真一 (埼玉大学 工学部 機能材料工学科) ,  吉田昼也 (埼玉大学 工学部 機能材料工学科) ,  青山崇 (埼玉大学 工学部 機能材料工学科) ,  浦田賢 (埼玉大学 工学部 機能材料工学科) ,  西垣功一 (埼玉大学 工学部 機能材料工学科)
資料名： Journal of Computer Chemistry, Japan  (Journal of Computer Chemistry, Japan)
巻： 5  号： 4  ページ： 213-218 (J-STAGE)  発行年： 2006年 
JST資料番号： L1437B  ISSN： 1347-1767  CODEN： JCCJAG  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： ペプチドのナノ秒(ns)分子動力学計算(MD)では、安定構造...

シソーラス用語： *分子動力学 ,...
準シソーラス用語： マッピング法 ,...

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分類 (2件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  ペプチド  (CF10080G)

引用文献 (10件)：

• [1] Gnanakaran S., Nymeyer H., Portman J., Sanbonmatsu K. Y., and Garcia A. E., Curr. Opin. Struc. Biol., 13, 168-174 (2003).
• [2] Snow C. D, Sorin E. J., Rhee Y. M., and Pande V. S., Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct., 34, 43-69 (2005).
• [3] Fetrow J. S., Giammona A., Kolinski A., Skolnick J., Curr. Pharm. Biotechnol., 3, 329-47 (2002).
• [4] Baldwin R. L. and Rose G. D., Trends Biochem. Sci., 24, 26-33 (1999).
• [5] Spörlen S., Carstens H., Statzger H., Renner C., Behrendt R., Moroder L., Tavan P., Zinth W., and Wachtveit J., Proc. Natl. Acad. Sci. USA., 99, 7998-8002 (2002).

タイトルに関連する用語 (7件)： ナノ秒 ,  MDシミュレーション ,  ペプチド ,  確率予測 ,  三角 ,  マップ表示 ,  有用性