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J-GLOBAL ID：200902275303590154   整理番号：09A1290745

水田土壌の脱窒誘導条件に応答する微生物集団を比較16S rRNA遺伝子分析によって明らかにする

Microbial Populations Responsive to Denitrification-Inducing Conditions in Rice Paddy Soil, as Revealed by Comparative 16S rRNA Gene Analysis

著者 (7件)： ISHII Satoshi (Univ. Tokyo, Tokyo, JPN) ,  YAMAMOTO Michihiro (Univ. Tokyo, Tokyo, JPN) ,  KIKUCHI Mami (Univ. Tokyo, Kashiwa, JPN) ,  OSHIMA Kenshiro (Univ. Tokyo, Kashiwa, JPN) ,  HATTORI Masahira (Univ. Tokyo, Kashiwa, JPN) ,  OTSUKA Shigeto (Univ. Tokyo, Tokyo, JPN) ,  SENOO Keishi (Univ. Tokyo, Tokyo, JPN)
資料名： Applied and Environmental Microbiology  (Applied and Environmental Microbiology)
巻： 75  号： 22  ページ： 7070-7078  発行年： 2009年11月 
JST資料番号： A0427A  ISSN： 0099-2240  CODEN： AEMIDF  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 1000クローン以上のほぼ完全長16S rRNA遺伝子のクローンライブラリー分析によって水田土壌の細菌集団の性質を調べた。脱窒誘導条件下でクローンライブラリーと比較することによって活性な細菌集団の同定を行った。水田土壌サンプルのクローンライブラリー分析によってSymbiobacterium,Firmicutesが優勢であることが分った。脱窒活性の強いサンプルではBurkholderiales,Rhodocyclalesが操作的分類単位(OTU)として優勢であった。これらOTUのほぼ半分はHerbaspirillum属であり脱窒活性のない土壌の10倍以上であった。Herbaspirillum関連のOTUが硝酸呼吸,脱窒における重要な菌群であった。

シソーラス用語： *水田土 ,  *土壌微生物 ,  rRNA遺伝子 ,  *脱窒菌 ,  細菌 ,  硝酸還元 ,  16S rRNA遺伝子 ,  Symbiobacterium thermophilum ,  硝酸呼吸 ,  バークホルデリア属 ,  ファーミキューテス門 ,  ハーバスピリルム属 ,  ロドシクルス科 ,  微生物
準シソーラス用語： Burkholderia ,  Firmicutes ,  Herbaspirillum ,  Rhodocyclaceae

分類 (1件)： 土壌生物  (FB04050N)

タイトルに関連する用語 (8件)： 水田土壌 ,  脱窒 ,  誘導 ,  応答 ,  微生物 ,  集団 ,  rRNA遺伝子 ,  分析