特許
J-GLOBAL ID:200903012624041686
グアノシン三リン酸結合タンパク質共役型の受容体
発明者:
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出願人/特許権者:
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公報種別:公開公報
出願番号(国際出願番号):特願2002-217260
公開番号(公開出願番号):特開2003-284573
出願日: 2002年06月17日
公開日(公表日): 2003年10月07日
要約:
【要約】 (修正有)【課題】 ヒトゲノム配列から効率的にGPCR配列を抽出する手法を開発し、これにより新規GPCRを網羅的に同定することを課題とする。【解決手段】 GPCR配列を発見するための自動システムを独自に開発した。このシステムは以下の3ちの段階からなる。第一段階は、遺伝債の予測、即ちゲノム配列からアミノ酸配列への翻訳である。第二段階は、アミノ酸配列の三重解析からなる。即ち、既知のGPCRデータベースに対する配列検索、モチーフ及びドメインの帰属、並びに膜貫通へリックスの予測である。3つの解析のそれぞれの結果の和集合をとることによって、候補配列をスクリーニングする。スクリーニングの段階では候補配列の数をできる限り最大限にするために和集合を用いた。第三段階は、重複配列を消去することによって、また誤予測によって分離された断片配列を融合することによって、遺伝子候補の質を更に精密化する段階である。
請求項(抜粋):
グアノシン三リン酸結合タンパク質共役型の受容体をコードする下記(a)から(d)のいずれかに記載のポリヌクレオチド。(a)配列番号:2から2070のうちのいずれかの偶数番号に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドをコードするポリヌクレオチド(b)配列番号:1から2069のうちのいずれかの奇数番号に記載の塩基配列のコード領域を含むポリヌクレオチド(c)配列番号:2から2070のうちのいずれかの偶数番号に記載のアミノ酸配列において1もしくは複数のアミノ酸が置換、欠失、付加および/または挿入したアミノ酸配列からなるポリペプチドをコードするポリヌクレオチド(d)配列番号:1から2069のうちのいずれかの奇数番号に記載の塩基配列からなるDNAにストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチド
IPC (13件):
C12N 15/09 ZNA
, A61K 35/76
, A61K 45/00
, A61K 48/00
, C07K 14/705
, C07K 16/28
, C12N 1/15
, C12N 1/19
, C12N 1/21
, C12N 5/10
, C12P 21/02
, C12Q 1/02
, C12Q 1/68
FI (13件):
A61K 35/76
, A61K 45/00
, A61K 48/00
, C07K 14/705
, C07K 16/28
, C12N 1/15
, C12N 1/19
, C12N 1/21
, C12P 21/02 C
, C12Q 1/02
, C12Q 1/68 A
, C12N 15/00 ZNA A
, C12N 5/00 A
Fターム (76件):
4B024AA01
, 4B024AA11
, 4B024BA63
, 4B024CA04
, 4B024CA05
, 4B024CA09
, 4B024CA11
, 4B024DA02
, 4B024DA06
, 4B024EA02
, 4B024EA04
, 4B024GA11
, 4B024GA18
, 4B024GA19
, 4B024HA03
, 4B024HA14
, 4B063QA01
, 4B063QA18
, 4B063QA19
, 4B063QQ03
, 4B063QQ20
, 4B063QQ42
, 4B063QQ52
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, 4B063QR38
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, 4H045DA86
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, 4H045EA50
, 4H045FA74
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