特許
J-GLOBAL ID:200903028067174604

コンセンサス配列の精度向上方法及びそれを用いたコンセンサス配列の決定方法

発明者:
出願人/特許権者:
代理人 (1件): 谷川 英次郎
公報種別:公開公報
出願番号(国際出願番号):特願2003-050422
公開番号(公開出願番号):特開2004-259094
出願日: 2003年02月27日
公開日(公表日): 2004年09月16日
要約:
【課題】公知の方法よりもさらにコンセンサス配列の精度を簡便に高めることができる、コンセンサス配列の精度向上方法を提供すること。【解決手段】このコンセンサス配列の精度向上方法では、(1)データベースに格納されているmRNA及び/又はESTの塩基配列に基づいて得られたコンセンサス配列を、相同性検索プログラムによりゲノムデータベースに格納されているゲノム配列と比較する。次に、(2)上記(1)のステップにより見出されたゲノム配列中の領域の配列で、該領域に対応するコンセンサス配列中の領域を置き換える。【選択図】 図1
請求項(抜粋):
(1)データベースに格納されているmRNA及び/又はESTの塩基配列に基づいて得られたコンセンサス配列を、相同性検索プログラムによりゲノムデータベースに格納されているゲノム配列と比較するステップ、(2)上記(1)のステップにより見出されたゲノム配列中の領域の配列で、該領域に対応するコンセンサス配列中の領域を置き換えるステップとを含む、コンセンサス配列の精度向上方法。
IPC (1件):
G06F17/30
FI (2件):
G06F17/30 170F ,  G06F17/30
Fターム (2件):
5B075ND02 ,  5B075UU19
引用特許:
審査官引用 (3件)
  • 転写配列を取得する方法
    公報種別:公開公報   出願番号:特願2000-377888   出願人:アイシン精機株式会社, 株式会社メイズ
  • 魚釣用電動リ-ル
    公報種別:公開公報   出願番号:特願2000-381120   出願人:ダイワ精工株式会社
  • ヒト組織に発現する完全長分子
    公報種別:公表公報   出願番号:特願2000-618453   出願人:インサイト・ゲノミックス・インコーポレイテッド
引用文献:
審査官引用 (1件)
  • Phred/phrap/consed - アセンブルとエディティング

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