特許
J-GLOBAL ID:200903047102114975
結合親和性を推定するための予測的スコア関数
発明者:
,
出願人/特許権者:
代理人 (2件):
恩田 博宣
, 恩田 誠
公報種別:公表公報
出願番号(国際出願番号):特願2007-539381
公開番号(公開出願番号):特表2008-518369
出願日: 2006年03月10日
公開日(公表日): 2008年05月29日
要約:
特定のレセプタとの提案リガンドの相互作用を表す値(VRI)を計算するためのコンピュータ処理方法。リガンド原子1つ以上とレセプタ原子1つ以上の間の疎水性相互作用は、レセプタによる該1つ以上のリガンド原子の疎水性囲いの存在に対してボーナスを授与する方法により採点される。また、リガンドとレセプタの間の荷電-荷電水素結合は、荷電-荷電水素結合に対するデフォルト値を設定すること、及び、1つ以上の特殊化され予め決定された荷電-荷電水素結合基準が満足された場合にデフォルト値を超えるボーナスを授与することにより採点される。種々の荷電-荷電水素結合基準を用いる。両性イオン、電荷、溶媒和、幾何構造及び静電的エネルギーを考慮する。
請求項(抜粋):
特定のレセプタとの提案リガンドの相互作用を表す値(VRI)を計算するためのコンピュータ処理方法であって、該方法は、1つ以上のリガンド原子と1つ以上のレセプタ原子との間の疎水性相互作用を、前記レセプタによる前記1つ以上のリガンド原子の疎水性囲いの存在に対してボーナスを授与することを含む方法により採点することを備え、前記ボーナスは前記リガンドと前記レセプタとの間の増強された結合親和性を示すVRIをもたらすものである、前記方法。
IPC (2件):
FI (2件):
G06F17/50 638
, G06F19/00 110
Fターム (2件):
引用特許:
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