特許
J-GLOBAL ID:200903053939136586
様々な条件下での複数の測定による二本鎖および三本鎖ハイブリダイゼーションの均質測定法
発明者:
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出願人/特許権者:
代理人 (1件):
恩田 博宣 (外1名)
公報種別:公表公報
出願番号(国際出願番号):特願2001-553386
公開番号(公開出願番号):特表2003-523738
出願日: 2001年01月23日
公開日(公表日): 2003年08月12日
要約:
【要約】本発明は、核酸のハイブリッド形成、検出および評価のための、均質測定法を提供する。該測定法は、試験試料に電圧を適用する前と適用している最中の両方で試験試料から信号を取得し、該信号を相関させることを含む。該信号の各々は、プローブと標的の互いの結合親和性を示す。完全に相補的なハイブリッド形成を除くかなり多くのハイブリッド形成を不安定にするよう電圧を較正できるため、この測定法により、プローブと標的間の対合の程度を決定することができる。結合親和性と大きさが相関する信号は、電気コンダクタンスおよび/または蛍光強度であり得る。好ましくは、測定法の信頼度を高めるために、両方の信号対を測定し、比較する。この測定法は、三本鎖を形成する一本鎖プローブと未変性二本鎖標的間の特定のハイブリッド形成を検出することができるため、標的を変性する必要性がなくなる。この測定法は、二本鎖ハイブリッド形成複合体にも適用することができる。
請求項(抜粋):
配列特異的なハイブリッド形成を測定する方法であって、 少なくとも1つの核酸配列を有する標的を提供する工程と、 核酸または核酸類似体の配列を有するプローブを提供する工程と、 前記プローブおよび前記標的をハイブリダイゼーション媒質に加えて、試験試料を提供する工程と、 前記試験試料に第1刺激を与えて、第1刺激された試験試料を提供する工程と、 前記第1刺激された試験試料から、前記プローブと前記標的間の結合親和性と相関する第1信号を検出する工程と、 前記標的と結合された少なくとも1つの基準プローブを含む基準試料が示す基準信号に対して前記第1信号を較正する工程であって、前記標的に比べて、前記プローブおよび前記少なくとも1つの基準プローブの各々は、完全対合、1塩基誤対合、2塩基誤対合、3塩基誤対合、1塩基欠失、2塩基欠失および3塩基欠失から成る群より選択された異なるメンバーである工程と、 前記較正から、前記プローブと前記標的間の対合の程度の第1決定値を決定する工程と、 前記第1刺激された試験試料に第2の刺激を加えて、第2刺激された試験試料を提供する工程と、 前記第2刺激された試験試料から、前記プローブと前記標的間の前記結合親和性と相関する第2信号を検出する工程と、 前記第2信号の前記検出から、前記プローブと前記標的間の対合の程度の第2決定値を決定する工程と、 前記第1決定値と前記第2決定値を比較する工程と、から成る方法。
IPC (12件):
C12N 15/09 ZNA
, C12Q 1/68
, G01N 21/64
, G01N 27/04
, G01N 27/06
, G01N 27/26 381
, G01N 27/416
, G01N 27/447
, G01N 33/483
, G01N 33/53
, G01N 33/58
, G01N 37/00 102
FI (14件):
C12Q 1/68 A
, G01N 21/64 F
, G01N 27/04 Z
, G01N 27/06 Z
, G01N 27/26 381 A
, G01N 33/483 F
, G01N 33/53 M
, G01N 33/58 A
, G01N 37/00 102
, C12N 15/00 ZNA A
, G01N 27/26 315 H
, G01N 27/26 325 A
, G01N 27/26 325 C
, G01N 27/46 301 M
Fターム (61件):
2G043AA01
, 2G043BA16
, 2G043DA02
, 2G043DA08
, 2G043EA01
, 2G043EA19
, 2G043KA01
, 2G043KA02
, 2G043KA03
, 2G043KA05
, 2G043KA09
, 2G043NA13
, 2G045AA35
, 2G045DA12
, 2G045DA13
, 2G045DA14
, 2G045FA34
, 2G045FB02
, 2G045FB07
, 2G045FB12
, 2G045GC15
, 2G045GC16
, 2G045GC20
, 2G060AA06
, 2G060AC10
, 2G060AD06
, 2G060AE17
, 2G060AE40
, 2G060AF02
, 2G060AF03
, 2G060AF08
, 2G060AF20
, 2G060FA01
, 2G060HA01
, 2G060HA02
, 2G060HC07
, 2G060HC10
, 2G060HD03
, 2G060HE01
, 2G060HE03
, 2G060KA05
, 4B024AA11
, 4B024AA20
, 4B024CA01
, 4B024CA09
, 4B024CA11
, 4B024HA13
, 4B024HA14
, 4B024HA19
, 4B024HA20
, 4B063QA13
, 4B063QQ41
, 4B063QR32
, 4B063QR35
, 4B063QR55
, 4B063QR66
, 4B063QR82
, 4B063QS34
, 4B063QS36
, 4B063QX02
, 4B063QX04
引用特許:
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