バイオマーカー産物レベルを疾患に相関させるための方法および装置

発明者： , , , , ,
出願人/特許権者：
代理人 (7件)：清水初志 , 刑部俊 , 新見浩一 , 小林智彦 , 渡邉伸一 , 井上隆一 , 大関雅人
公報種別：公表公報
出願番号（国際出願番号）：特願2008-536621
公開番号（公開出願番号）：特表2009-512440
出願日： 2006年10月23日
公開日（公表日）： 2009年03月26日
要約：

1つの局面において本発明は、選択されたバイオマーカー産物レベルに対応するデータを提供し、かつデータを公式に適用して試験個体が1つもしくは複数の結腸直腸病変、または1つもしくは複数のサブタイプの結腸直腸病変を有するか否かに関する指標を提供することによって、試験個体における1つもしくは複数の結腸直腸病変、または1つもしくは複数のサブタイプの結腸直腸病変(1つの態様において結腸直腸癌)を試験する方法である。いくつかの局面において、本方法はコンピュータに基づき、コンピュータはデータを公式に適用する。他の局面において、コンピュータシステムは、プロセッサに、試験個体が結腸直腸病変を有するか否かの指標をユーザーに提供させる指令で構成される。いくつかの態様においてコンピュータ可読媒体を含む、選択されたバイオマーカー産物に対応するデータを測定するためのキットも含まれる。1つまたは複数の結腸直腸病変の処置の治療有効性をモニターするためのキットおよび方法も含まれる。

請求項（抜粋）：

以下の段階を含む、試験対象における1つまたは複数の結腸直腸病変を試験する方法: (a)試験対象から単離されたおよび/または試験対象に由来する試料における少なくとも2つのバイオマーカーのそれぞれの1つまたは複数の産物レベルを表すデータを提供する段階であって、バイオマーカーが、BCNP1、CD163、CDA、MS4A1、BANK1、およびMGC20553からなる群より選択される遺伝子である、段階;ならびに (b)(i)1つまたは複数の病変を有する参照集団の各対象におけるバイオマーカーのそれぞれの1つまたは複数の産物のレベルを表すデータセット、および (ii)1つまたは複数の病変を有しない参照集団の各対象におけるバイオマーカーのそれぞれの1つまたは複数の産物レベルを表すデータセットに基づく公式を該データに適用し、それによって試験対象が1つまたは複数の結腸直腸病変を有する確率の指標を提供する段階。

IPC (4件)：

C12Q 1/68 , G01N 33/50 , G01N 33/49 , C12N 15/09

FI (4件)：

C12Q1/68 A , G01N33/50 P , G01N33/49 Y , C12N15/00 A

Fターム (17件)：

2G045AA26 , 2G045CA26 , 2G045DA12 , 2G045DA13 , 2G045DA14 , 4B024AA11 , 4B024CA04 , 4B024CA09 , 4B024CA20 , 4B024HA14 , 4B063QA01 , 4B063QA19 , 4B063QQ52 , 4B063QR08 , 4B063QR55 , 4B063QR62 , 4B063QS34

引用特許：

出願人引用 (2件)

Shuber et al. 米国特許出願第2005-0260638A1号
Lofton-Day et al. WO2005/001142

審査官引用 (1件)

生物学的ネットワークモデルのテスト方法
公報種別：公表公報出願番号：特願2000-554875 出願人：ロゼッタ・インファーマティクス・インコーポレーテッド

引用文献：

審査官引用 (1件)

Gene-expression profile of colorectal adenocarcinoma tissue identified by gene microarray analysis.

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