特許
J-GLOBAL ID:200903082635854415

制約による高速・高精度な糖鎖配列決定法

発明者:
出願人/特許権者:
公報種別:公開公報
出願番号(国際出願番号):特願2007-031252
公開番号(公開出願番号):特開2008-175793
出願日: 2007年01月16日
公開日(公表日): 2008年07月31日
要約:
【課題】質量スペクトル上の多数のピークから高速・高精度に糖鎖の配列を決定する。【解決手段】分析対象となる糖鎖および開裂施行によって得た複数の糖鎖断片に開裂施行を含む質量分析を行い、得られた複数の質量データとあらかじめ求められている各種糖鎖の構造または配列データとを照合し糖鎖配列を決定すること、もしくは質量スペクトル中の質量ピーク自身の組合せにより、糖鎖配列を直接的に決定することにおいて発生する膨大な配列決定演算を糖鎖の生合成における配列・構造特性ならびに開裂前の分析質量における制約を用いて減少させることで、実測の質量スペクトルが示す糖鎖配列を決定する。
請求項(抜粋):
分析対象となる糖鎖および開裂施行により得た複数の糖鎖断片に対して開裂試行を含む質量分析を行い、得られた複数の質量スペクトルをあらかじめ求められている各種糖鎖の構造または配列データと照合し糖鎖配列を決定すること、もしくは糖鎖を構成する単糖の質量と質量スペクトル中の質量ピーク自身の組合せにより糖鎖配列を直接的に決定することにおいて発生する膨大な配列決定演算を糖鎖の生合成特性による制約を用いて減少させることを特徴とする実測の質量スペクトルが示す糖鎖配列を決定する方法。
IPC (1件):
G01N 27/62
FI (2件):
G01N27/62 D ,  G01N27/62 V
Fターム (5件):
2G041CA01 ,  2G041FA10 ,  2G041GA09 ,  2G041KA01 ,  2G041LA07
引用特許:
出願人引用 (2件)

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