特許
J-GLOBAL ID:200903088053798624
マイクロサテライトマーカーを用いるシバ属植物品種判別法
発明者:
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出願人/特許権者:
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代理人 (6件):
清水 初志
, 刑部 俊
, 新見 浩一
, 小林 智彦
, 渡邉 伸一
, 井上 隆一
公報種別:公開公報
出願番号(国際出願番号):特願2008-093038
公開番号(公開出願番号):特開2009-240268
出願日: 2008年03月31日
公開日(公表日): 2009年10月22日
要約:
【課題】対照シバ属植物のゲノムDNAにおける特定のマイクロサテライト座位の遺伝子型であって、対照シバ属植物品種に特異的な遺伝子型を指標とする被検シバ属植物の品種判別法などを提供することを課題とする。【解決手段】ノシバの地上部、地下部ならびにカルス由来のESTから、マイクロサテライトを抽出し、それらを含むPCR断片が得られるようにプライマーを設計した。多品種のシバ属植物それぞれについて、ゲノムDNAを鋳型として、設計したプライマーペアを用いてPCRを行ない、それらのPCR産物に対して蛍光ラベル反応を行い、DNAアナライザーによる電気泳動で分離した。その結果、品種特異的なPCR断片長を検出することができ、品種特異的なPCR断片長を指標に被検シバ属植物の品種判定を行えることが判明した。【選択図】なし
請求項(抜粋):
下記(a)に記載の遺伝子型、及び、下記(b)に記載の遺伝子型を比較する工程を含む被検シバ属植物の品種判別法であって、前記工程において比較した遺伝子型が一致したときに、被検シバ属植物の品種が、対照シバ属植物と同一の品種であると判別される方法;
(a)対照シバ属植物のゲノムDNAにおける下記(1)から(13)からなる群より選択される少なくとも1つのマイクロサテライト座位の遺伝子型であって、対照シバ属植物に特異的な遺伝子型、
(b)被検シバ属植物のゲノムDNAにおける(a)と同じ座位の遺伝子型、
(1)配列番号:1に記載の塩基配列と相補的な塩基配列、及び、配列番号:2に記載の塩基配列と相補的な塩基配列によって挟まれるマイクロサテライト座位、
(2)配列番号:3に記載の塩基配列と相補的な塩基配列、及び、配列番号:4に記載の塩基配列と相補的な塩基配列によって挟まれるマイクロサテライト座位、
(3)配列番号:5に記載の塩基配列と相補的な塩基配列、及び、配列番号:6に記載の塩基配列と相補的な塩基配列によって挟まれるマイクロサテライト座位、
(4)配列番号:7に記載の塩基配列と相補的な塩基配列、及び、配列番号:8に記載の塩基配列と相補的な塩基配列によって挟まれるマイクロサテライト座位、
(5)配列番号:9に記載の塩基配列と相補的な塩基配列、及び、配列番号:10に記載の塩基配列と相補的な塩基配列によって挟まれるマイクロサテライト座位、
(6)配列番号:11に記載の塩基配列と相補的な塩基配列、及び、配列番号:12に記載の塩基配列と相補的な塩基配列によって挟まれるマイクロサテライト座位、
(7)配列番号:13に記載の塩基配列と相補的な塩基配列、及び、配列番号:14に記載の塩基配列と相補的な塩基配列によって挟まれるマイクロサテライト座位、
(8)配列番号:15に記載の塩基配列と相補的な塩基配列、及び、配列番号:16に記載の塩基配列と相補的な塩基配列によって挟まれるマイクロサテライト座位、
(9)配列番号:17に記載の塩基配列と相補的な塩基配列、及び、配列番号:18に記載の塩基配列と相補的な塩基配列によって挟まれるマイクロサテライト座位、
(10)配列番号:19に記載の塩基配列と相補的な塩基配列、及び、配列番号:20に記載の塩基配列と相補的な塩基配列によって挟まれるマイクロサテライト座位、
(11)配列番号:21に記載の塩基配列と相補的な塩基配列、及び、配列番号:22に記載の塩基配列と相補的な塩基配列によって挟まれるマイクロサテライト座位、
(12)配列番号:23に記載の塩基配列と相補的な塩基配列、及び、配列番号:24に記載の塩基配列と相補的な塩基配列によって挟まれるマイクロサテライト座位、並びに、
(13)配列番号:25に記載の塩基配列と相補的な塩基配列、及び、配列番号:26に記載の塩基配列と相補的な塩基配列によって挟まれるマイクロサテライト座位。
IPC (2件):
FI (2件):
Fターム (14件):
4B024AA07
, 4B024CA04
, 4B024HA14
, 4B063QA01
, 4B063QA18
, 4B063QQ04
, 4B063QQ42
, 4B063QR32
, 4B063QR38
, 4B063QR62
, 4B063QR73
, 4B063QS25
, 4B063QS34
, 4B063QX02
引用特許:
出願人引用 (3件)
審査官引用 (1件)
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シバ属植物の個体識別方法
公報種別:公開公報
出願番号:特願2003-271137
出願人:独立行政法人農業・生物系特定産業技術研究機構, 明石良, 株式会社宮崎芝園
引用文献:
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