分類および同定のためのオリゴヌクレオチドタグ

発明者： ,
出願人/特許権者：
代理人 (1件)：山本秀策
公報種別：公表公報
出願番号（国際出願番号）：特願平9-501818
公開番号（公開出願番号）：特表平11-507528
出願日： 1996年06月06日
公開日（公表日）： 1999年07月06日
要約：

【要約】本発明は、オリゴヌクレオチドタグの使用により、分子の種類または亜集団の探知、同定、および/または分類する方法を提供する。本発明のオリゴヌクレオチドタグは、最少に交差ハイブリダイズするセットから選択されるオリゴヌクレオチドを含む。好ましくは、このようなオリゴヌクレオチドのそれぞれは、長さが3〜9ヌクレオチドの複数のサブユニットからなる。最少に交差ハイブリダイズするセットのサブユニットは、同じセットの任意の他のサブユニットの相補物と2つ以上のミスマッチを有する二重鎖または三重鎖を形成する。特定の実施態様で有効なオリゴヌクレオチドタグの数は、1タグ当たりのサブユニットの数およびサブユニットの長さに依存する。本発明の重要な局面は、固相支持体上で、ポリヌクレオチドに結合されるタグをその相補物に特異的にハイブリダイズすることにより、ポリヌクレオチドを分類するためにオリゴヌクレオチドタグの使用することである。この実施態様は、ポリヌクレオチドの操作および分類のために、特に大規模並行操作(例えば、大規模DNA配列決定、mRNAフィンガープリンティングなど)において有用な容易に自動化されたシステムを提供し、ここで、多くの標的ポリヌクレオチドまたは1つの標的ポリヌクレオチドの多くのセグメントが、同時に配列決定される。

請求項（抜粋）：

1つまたはそれ以上の固相支持体上でポリヌクレオチドの集団からポリヌクレオチドを分類する方法であって、以下の工程を包含する方法: (a)タグのレパートリー由来のオリゴヌクレオチドタグを、該レパートリー由来の各オリゴヌクレオチドタグが最少に交差ハイブリダイズする同じセットから選択されるように、ポリヌクレオチド集団中の各ポリヌクレオチドに結合させる工程; (b)該集団中の実質的にすべての異なるポリヌクレオチドが異なる結合オリゴヌクレオチドタグを有するように、ポリヌクレオチドの該集団をサンプリングする工程;および (c)オリゴヌクレオチドタグをその個々の相補物と特異的にハイブリダイズさせることにより、該集団から該ポリヌクレオチドを分類する工程であって、該相補物のそれぞれが、1つまたはそれ以上の固相支持体の空間的に離れている領域において実質的に同じオリゴヌクレオチドの均一な集団として結合する、工程。

IPC (2件)：

C12Q 1/68 , C12N 15/09 ZNA

FI (3件)：

C12Q 1/68 A , C12Q 1/68 Z , C12N 15/00 ZNA A

引用特許：

審査官引用 (5件)

分子タグ化システム
公報種別：公表公報出願番号：特願平8-513298 出願人：リンクスセラピューティクス,インコーポレイテッド
特開平1-137982
DNA断片の分取法
公報種別：公開公報出願番号：特願平3-149748 出願人：住友電気工業株式会社

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