研究者
J-GLOBAL ID：201001007717673941   更新日: 2024年11月18日

浜田 道昭

ハマダ ミチアキ | MICHIAKI HAMADA
所属機関・部署：
早稲田大学 理工学術院

早稲田大学 理工学術院 について


職名： 教授
その他の所属（所属・部署名・職名） (2件)：
  • 国立研究開発法人産業技術総合研究所  生体システムビッグデータ解析オープンイノベーションラボラトリ   招聘研究員(班長)
  • 日本医科大学  大学院医学研究科   客員教授
ホームページURL (1件)： https://www.hamadalab.com/
研究分野 (4件)： システムゲノム科学 ,  ゲノム生物学 ,  生命、健康、医療情報学 ,  知能情報学
研究キーワード (13件)： RNA創薬 ,  人工知能 ,  確率モデル ,  RNA-タンパク質相互作用 ,  RNA-RNA相互作用 ,  インタラクトーム ,  長鎖ノンコーディングRNA ,  エピトランスクリプトーム ,  エピゲノム ,  RNAアプタマー ,  配列情報解析 ,  RNA ,  バイオインフォマティクス
競争的資金等の研究課題 (23件)：
  • 2022 - 2028 先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム
  • 2024 - 2027 RNAリインカネーション
  • 2024 - 2026 加齢による骨格筋細胞の生体変容に関わるlncRNAのランドスケープ
  • 2023 - 2026 RNAを中心とした分子ネットワークに基づく生物学的相分離の俯瞰的・体系的理解
  • 2021 - 2024 AIアプタマー創薬プロジェクト
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論文 (130件)：
  • Keisuke Yamada, Kanta Suga, Naoko Abe, Koji Hashimoto, Susumu Tsutsumi, Masahito Inagaki, Fumitaka Hashiya, Hiroshi Abe, Michiaki Hamada. Multi-objective computational optimization of human 5′ UTR sequences. 2024
  • Kenzui Taniue, Anzu Sugawara, Chao Zeng, Han Han, Xinyue Gao, Yuki Shimoura, Atsuko Nakanishi Ozeki, Rena Onoguchi-Mizutani, Masahide Seki, Yutaka Suzuki, et al. The MTR4/hnRNPK complex surveils aberrant polyadenylated RNAs with multiple exons. Nature communications. 2024. 15. 1. 8684-8684
  • Masato Kosuge, Jumpei Ito, Michiaki Hamada. Landscape of evolutionary arms races between transposable elements and KRAB-ZFP family. Scientific reports. 2024. 14. 1. 23358-23358
  • Hitoshi Iuchi, Michiaki Hamada. The Lomb-Scargle periodogram-based differentially expressed gene detection along pseudotime. 2024
  • Yutaro Wakabayashi, Aika Shimono, Yuki Terauchi, Chao Zeng, Michiaki Hamada, Kentaro Semba, Shinya Watanabe, Kosuke Ishikawa. Identification of a novel RNA transcript TISPL upregulated by stressors that stimulate ATF4. Gene. 2024. 917. 148464-148464
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MISC (34件)：
  • Tsukasa Fukunaga, Michiaki Hamada. Fast RNA-RNA Interaction Prediction Methods for Interaction Analysis of Transcriptome-Scale Large Datasets. Methods in molecular biology (Clifton, N.J.). 2023. 2586. 163-173
  • 高橋 聡, 野呂 林太郎, 吉川 明子, 中道 真仁, 菅野 哲平, 松本 優, 武内 進, 平尾 真季子, 松田 久仁子, Zeng Chao, et al. ドライバー遺伝子異常肺癌の薬剤耐性機序における長鎖ノンコーディングRNAの意義. 日本呼吸器学会誌. 2020. 9. 増刊. 177-177
  • 高橋 聡, 野呂 林太郎, 吉川 明子, 中道 真仁, 菅野 哲平, 松本 優, 武内 進, 平尾 真季子, 松田 久仁子, Zeng Chao, et al. ドライバー遺伝子異常肺癌の薬剤耐性機序における長鎖ノンコーディングRNAの意義. 日本呼吸器学会誌. 2020. 9. 増刊. 177-177
  • Akira Orimo, Yasuhiko Ito, Yoshihiro Mezawa, Kaidiliavi Sulidan, Yataro Daigo, Nadila Wali, Okio Hino, Kazuyoshi Takeda, Michiaki Hamada, Yuko Matsumura. CAFs induce formation of metastatic human breast tumor cell clusters with partial epithelial-mesenchymal transition. CANCER SCIENCE. 2018. 109. 797-797
  • 藤田 理紗, 有村 泰宏, 山本 達郎, 浜田 道昭, 斉藤 典子, 胡桃坂 仁志. 非コードRNA Eleanorはヌクレオソーム中のヒストンの交換を促進する. 生命科学系学会合同年次大会. 2017. 2017年度. [3PT18-0555)]
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特許 (4件)：
書籍 (14件)：
  • ゲノム配列情報解析
    コロナ社 2024 ISBN:9784339027358
  • 核酸医薬 〜モダリティ・合成・分析・DDSの最新動向〜
    (株)エヌ・ティー・エス 2024 ISBN:9784860438869
  • あなたのラボから薬を生み出すアカデミア創薬の実践 : all Japan体制の先端技術支援を利用した創薬の最前線
    羊土社 2024 ISBN:9784758104166
  • 機械学習を用いた アプタマー配列の解析と創薬、実験医学別冊 Pythonで実践 生命科学データの機械学習
    羊土社 2023 ISBN:9784758122634
  • 機械学習による遺伝子転写制御に関わる因子の探索, 月刊細胞
    ニューサイエンス社 2022
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講演・口頭発表等 (52件)：
  • タンパク質言語モデルを用いたコロナウイルスの宿主予測
    (生命情報科学若手の会 第16回年会)
  • トランスポゾンのサブファミリー分類手法の確立
    (生命情報科学若手の会 第16回年会)
  • Prefix-tuned RNA言語モデルによる新規タンパク質結合RNA配列の生成
    (生命情報科学若手の会 第16回年会)
  • 大規模ゲノムに適用可能なde novo散在反復配列検出手法の開発
    (生命情報科学若手の会 第16回年会)
  • トランスポゾンとKRAB-ZFPの進化的軍拡競争
    (生命情報科学若手の会 第16回年会)
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学歴 (3件)：
  • 2005 - 2009 東京工業大学 総合理工学研究科 知能システム科学専攻
  • 2000 - 2002 東北大学 大学院理学研究科 数学専攻
  • 1996 - 2000 東北大学 理学部 数学科
学位 (1件)：
  • 博士(理学) (東京工業大学)
経歴 (8件)：
  • 2023/04 - 現在 日本バイオインフォマティクス学会 副理事長
  • 2022/04 - 現在 早稲田大学 次代の中核研究者
  • 2018/04 - 現在 早稲田大学 理工学術院 教授
  • 2017/04 - 現在 日本医科大学 客員教授
  • 2016/10 - 現在 産業技術総合研究所 生体システムビッグデータ解析オープ ンイノベーションラボラトリ(CBBD-OIL) 招聘研究員 / 班長
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委員歴 (5件)：
  • 2023/04 - 現在 日本バイオインフォマティクス学会 副理事長
  • 2022/06 - 現在 mRNAターゲット創薬研究機構 理事
  • 2020/04 - 現在 日本バイオインフォマティクス学会 幹事
  • 2021/09 - 2021年日本バイオインフォマティクス学会年会・第10回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2021) 大会長
  • 2015/04 - 2017/03 日本バイオインフォマティクス学会 理事
受賞 (6件)：
  • 2024/11 - 早稲田大学 大隈記念学術褒賞(奨励賞)
  • 2023/07 - 早稲田大学 早稲田大学ティーチングアワード バイオインフォマティクス
  • 2022/04 - 早稲田大学 早稲田大学 次代の中核研究者 2022
  • 2021/12 - 早稲田大学 早稲田大学リサーチアワード(国際研究発信力)
  • 2017/04 - 文部科学省 平成29年度科学技術分野の文部科学大臣表彰 若手科学者賞
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