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J-GLOBAL ID：201002218025586008   整理番号：10A0222921

分子動力学シミュレーションによる臨床的に単離したサブタイプC HIV-1プロテイナーゼと認可阻害剤の複合体に関する構造上とエネルギー学的解析

Structural and Energetic Analysis on the Complexes of Clinically Isolated Subtype C HIV-1 Proteases and Approved Inhibitors by Molecular Dynamics Simulation

著者 (7件)： MATSUYAMA Shou (Chiba Univ., Chiba, JPN) ,  AYDAN Ay (Chiba Univ., Chiba, JPN) ,  ODE Hirotaka (Chiba Univ., Chiba, JPN) ,  HATA Masayuki (Matsuyama Univ., Matsuyama, JPN) ,  SUGIURA Wataru (National Inst. of Infectious Diseases, Tokyo, JPN) ,  SUGIURA Wataru (Nagoya Medical Center, Nagoya, JPN) ,  HOSHINO Tyuji (Chiba Univ., Chiba, JPN)
資料名： Journal of Physical Chemistry B  (Journal of Physical Chemistry B)
巻： 114  号： 1  ページ： 521-530  発行年： 2010年01月14日 
JST資料番号： W0921A  ISSN： 1520-6106  CODEN： JPCBFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： HIV-1は二種類の形HIV-1とHIV-2に分離され,世界中の患者の多くはHIV-1のキャリアである。遺伝的多様性をもったHIV-1は三群,M(主群),O(アウトライア)及びN(非M/非O)に分類され,M群のウイルスは更に9種のサブタイプと幾つかの循環組換え形(CRF)に分割される。9種のサブタイプ中サブタイプB HIV-1は先進国の患者に見いだされる。対照的に,患者数が増加する開発途上国では非Bサブタイプウイルス,特にサブタイプC HIV-1に感染している。非BサブタイプHIV-1における突然変異または多形が認可阻害剤の有効性にいかに影響を及ぼすか明らかにすることが残された課題である。ここでは,三種類の認可阻害剤,アタザナビル,ネルフィナビル及びサキナビルとの複合体中の臨床的に単離したサブタイプC HIV-1プロテイナーゼに関する分子動力学シミュレーションを行った。構造上とエネルギー学的見地から阻害剤結合に影響する多形を同定した。サブタイプC HIV-1中V82I突然変異が化学薬品との会合に及ぼす効果とD30N突然変異の稀な出現理由をHIV-1プロテイナーゼ中の残基の幾何学変化の面で考察した。

シソーラス用語： *プロテイナーゼ阻害剤 ,  抗エイズ薬 ,  *HIV1 ,  *遺伝子型 ,  *突然変異 ,  アミノ酸残基 ,  アスパラギン酸プロテイナーゼ ,  ウイルスタンパク質 ,  臨床分離菌 ,  感受性 ,  許認可 ,  自由エネルギー ,  計算機シミュレーション ,  分子動力学 ,  生物多様性 ,  遺伝子多型 ,  有効性 ,  HIVプロテイナーゼ ,  ウイルス感受性 ,  酵素阻害剤複合体 ,  分子動力学シミュレーション ,  遺伝多様性 ,  *微生物 ,  *動物ウイルス ,  計算機利用 ,  利用
準シソーラス用語： サブタイプ ,  遺伝的多型 ,  遺伝的多様性 ,  医薬品認可 ,  有効性評価

分類 (2件)： 抗ウイルス薬の臨床への応用  (GW17050Z) ,  薬物の物理化学的性質  (GV01060M)

物質索引 (3件)： アタザナビル ,  サキナビル ,  ネルフィナビル

タイトルに関連する用語 (11件)： 分子動力学シミュレーション ,  臨床 ,  単離 ,  サブ ,  タイプ ,  HIV-1プロテイナーゼ ,  認可 ,  阻害剤 ,  複合体 ,  エネルギー学 ,  解析