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J-GLOBAL ID：201002227090063739   整理番号：10A0370159

ヌクレオソームの動態によって転写エンハンサーが定まる

Nucleosome dynamics define transcriptional enhancers

著者 (16件)： HE Housheng Hansen (Harvard School of Public Health, Massachusetts, USA) ,  MEYER Clifford A (Harvard School of Public Health, Massachusetts, USA) ,  SHIN Hyunjin (Harvard School of Public Health, Massachusetts, USA) ,  ZHANG Yong (Harvard School of Public Health, Massachusetts, USA) ,  LIU X Shirley (Harvard School of Public Health, Massachusetts, USA) ,  HE Housheng Hansen (Harvard Medical School, Massachusetts, USA) ,  BAILEY Shannon T (Harvard Medical School, Massachusetts, USA) ,  WANG Qianben (Harvard Medical School, Massachusetts, USA) ,  XU Kexin (Harvard Medical School, Massachusetts, USA) ,  NI Min (Harvard Medical School, Massachusetts, USA) ,  LUPIEN Mathieu (Harvard Medical School, Massachusetts, USA) ,  BROWN Myles (Harvard Medical School, Massachusetts, USA) ,  WEI Gang (National Inst. of Health, Maryland, USA) ,  ZHAO Keji (National Inst. of Health, Maryland, USA) ,  MIECZKOWSKI Piotr (Univ. North Carolina, North Carolina, USA) ,  LIEB Jason D (Univ. North Carolina, North Carolina, USA)
資料名： Nature Genetics  (Nature Genetics)
巻： 42  号： 4  ページ： 343-347  発行年： 2010年04月 
JST資料番号： W0430A  ISSN： 1061-4036  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： クロマチンは真核生物の遺伝子発現調節において中心的な役割を果たす。本論文では,エピジェネティックに刻印されたヌクレオソームのゲノムワイドマッピングを行い,ヌクレオソームの位置を転写開始部位近傍およびエンハンサーなどの遠位調節配列の両方について求めた。その結果,前立腺がんの細胞ではアンドロゲン受容体が主としてエンハンサー領域に結合するが,アンドロゲン刺激によって,ヌクレオソームが消失することを見つけた。そのヌクレオソームはアンドロゲン受容体結合部位に存在し,エピジェネティックに刻印されたヌクレオソーム対に両側を挟まれていたものである。そこで,このようなヌクレオソーム対の動態をもとに新たな定量モデルを構築し,アンドロゲン受容体やFOXA1をはじめとする,アンドロゲン刺激にすぐさま応答する調節因子が結合する領域を同定した。さらに重要なことに,これらの因子とは別の,長期にわたるアンドロゲン刺激後に出現する,OCT1やNKX3-1といった転写因子の,これまで明らかになっていなかった結合部位も,このモデルによって正確に予測できた。したがって,エンハンサー構造についての定量モデルは,特定の刺激に対する細胞応答にかかわる,転写因子の実体を推測する強力な予測法となる。Copyright Nature Publishing Group 2010

シソーラス用語： *ヌクレオソーム ,  *エンハンサー領域 ,  前立腺腫瘍 ,  アンドロゲン受容体 ,  男性ホルモン ,  結合部位 ,  DNA結合タンパク質 ,  転写因子 ,  遺伝的調節 ,  遺伝学 ,  エピジェネティクス
準シソーラス用語： NKX3-1 ,  Oct-1

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (2件)： ヌクレオソーム ,  転写