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J-GLOBAL ID：201002243191788349   整理番号：10A0531353

保存水チャンネルを用いるチトクロームP450 3A4の触媒サイクルを調整するためいかにレダクターゼは支援するか?

How Does the Reductase Help To Regulate the Catalytic Cycle of Cytochrome P450 3A4 Using the Conserved Water Channel?

著者 (5件)： FISHELOVITCH Dan (Tel Aviv Univ., Tel Aviv, ISR) ,  SHAIK Sason (Hebrew Univ. Jerusalem, Jerusalem, ISR) ,  WOLFSON Haim J. (Tel Aviv Univ., Tel Aviv, ISR) ,  NUSSINOV Ruth (Tel Aviv Univ., Tel Aviv, ISR) ,  NUSSINOV Ruth (SAIC-Frederick, Inc., Maryland)
資料名： Journal of Physical Chemistry B  (Journal of Physical Chemistry B)
巻： 114  号： 17  ページ： 5964-5970  発行年： 2010年05月06日 
JST資料番号： W0921A  ISSN： 1520-6106  CODEN： JPCBFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 水分子はP450触媒サイクルにおいて重要役割を演じる。ヒトチトクロームP450 3A4(CYP3A4)について,選好水経路とそれらのゲート機構を確かめ,これらの水チャンネルを変えまたは活性化するチトクロームP450レダクターゼ(CPR)の役割を解明した。基質が活性部位に入込んだとき,基質が水分子を追出せば,引き続くプロトン化段階はなにを生じるか?プロトンをシャトルする水分子がこの段階を生じ,このように触媒サイクルを通して水分子が活性部位に出入りする。二種類の基質に未結合と結合したCPRのフラビンモノヌクレオチド(FMN)結合ドメインの有無でCYP3A4の明示溶媒分子動力学シミュレーションを行った。活性部位とヘム近位面間に位置した水特異及び保存チャンネル(水管)を経由した水分子の出入り,通過を観測した。R375,塩がヘム7-プロピオナートと架橋した保存アルギニンが水管ゲート機構を仲介することを見いだした。R375が回転するとき,水管を開放し,活性部位の水分子ネットワークのクラスタとバルク溶媒間の連結を確立する。水管領域はCYP3A4へのCPR結合部位と重なり合う。事実,CPRのFMN結合ドメインがCYP3A4に結合し,水管が完全開放し,それによって水分子の流動を可能にする。水管開放はプロトン移動を可能にし,秩序化水分子を通して活性部位へプロトンをシャトルする。更に,水管を経由した水分子の排除は基質結合に寄与する。このようにCPR結合は機能をもつ:水管開放をトリガーし,それによって二酸素活性化に必要なプロトンシャトル経路を可能にした。

シソーラス用語： *チトクロームP450 ,  サイクル ,  触媒活性 ,  *ヘムタンパク質レダクターゼ ,  水分子 ,  プロトン化 ,  *活性部位 ,  *リボヌクレオチド ,  結合部位 ,  水管 ,  アミノ酸残基 ,  分子構造 ,  計算機シミュレーション ,  分子動力学 ,  水チャンネル ,  プロトン移動 ,  窒素複素環化合物 ,  ウレア化合物 ,  無機酸エステル ,  芳香族縮合化合物 ,  ポリオール
準シソーラス用語： チトクロームP450 3A4 ,  チトクロームP450レダクターゼ ,  リガンド結合ドメイン ,  化学構造 ,  触媒サイクル ,  分子動力学シミュレーション

分類 (1件)： 蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N)

物質索引 (1件)： フラビンモノヌクレオチド

タイトルに関連する用語 (6件)： 保存 ,  水チャンネル ,  チトクロームP450 ,  触媒サイクル ,  レダクターゼ ,  支援