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J-GLOBAL ID：201002253827812240   整理番号：10A0960602

大規模並列処理mRNA配列決定によるAspergillus oryzaeのトランスクリプトームの概観

Survey of the transcriptome of Aspergillus oryzae via massively parallel mRNA sequencing

著者 (13件)： WANG Bin (South China Univ. Technol., Guangdong) ,  GUO Guangwu (Beijing Inst. of Genomics, Chinese Acad. of Sci., Beijing) ,  GUO Guangwu (Graduate Univ., Chinese Acad. Sci., Beijing) ,  GUO Guangwu (Beijing Genomics Inst. at Shenzhen, Shenzhen) ,  WANG Chao (South China Univ. Technol., Guangdong) ,  LIN Ying (South China Univ. Technol., Guangdong) ,  WANG Xiaoning (South China Univ. Technol., Guangdong) ,  ZHAO Mouming (South China Univ. Technol., Guangdong, CHN) ,  GUO Yong (South China Univ. Technol., Guangdong) ,  HE Minghui (South China Univ. Technol., Guangdong) ,  HE Minghui (Beijing Genomics Inst. at Shenzhen, Shenzhen) ,  ZHANG Yong (Beijing Genomics Inst. at Shenzhen, Shenzhen) ,  PAN Li (South China Univ. Technol., Guangdong)
資料名： Nucleic Acids Research  (Nucleic Acids Research)
巻： 38  号： 15  ページ： 5075-5087  発行年： 2010年 
JST資料番号： D0242C  ISSN： 0305-1048  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Aspergillus oryzaeは食品工業において重要な真菌類であるが,そのトランスクリプトームの複雑な機能は未知の部分が多い。本論文は,異なる培養条件で得られたA.oryzaeトランスクリプトームに直接ハイスループット対-末端RNA配列決定(RNA-Seq)を適用した結果に関する。RNA-Seqは従来から用いられている発現配列タグ(EST)やマイクロアレイ法に比較し,トランスクリプトーム全体の精確かつ詳細な探査を可能にすることを示した。即ち遺伝子注釈に豊富な情報を加えるゲノムの蛋白質コードの全体像が得られ,蛋白質分泌や多くの小胞体関連プロセスを解明することが出来た。液体培養に比較して,固体培養の方が高レベルの蛋白質産生に関与する多くの遺伝子や経路が発現されることを認めた。

シソーラス用語： ヌクレオチド配列 ,  mRNA ,  *トランスクリプトーム ,  *遺伝学実験技術 ,  *解析 ,  並列処理 ,  超並列処理 ,  培養条件 ,  スループット ,  遺伝子発現 ,  Aspergillus oryzae
準シソーラス用語： 米麹菌 ,  *トランスクリプトーム解析 ,  ハイスループット

分類 (2件)： 核酸一般  (EB04010U) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (5件)： 大規模 ,  並列処理 ,  mRNA ,  Aspergillus ,  トランスクリプトーム