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J-GLOBAL ID：201002256932830814   整理番号：10A0335918

Bacillus pallidus D-アラビノースイソメラーゼ及びL-フシトールとそれの複合体のX線構造

X-ray structures of Bacillus pallidus d-arabinose isomerase and its complex with l-fucitol

著者 (5件)： TAKEDA Kosei (Life Sci. Res. Center and Fac. of Medicine, Kagawa Univ., 1750-1, Ikenobe, Miki-cho, Kita-gun, Kagawa 761-0793, JPN) ,  TAKEDA Kosei (Rare Sugar Res. Center and Fac. of Agriculture, Kagawa Univ., Miki-cho, Kagawa 761-0795, JPN) ,  YOSHIDA Hiromi (Life Sci. Res. Center and Fac. of Medicine, Kagawa Univ., 1750-1, Ikenobe, Miki-cho, Kita-gun, Kagawa 761-0793, JPN) ,  IZUMORI Ken (Rare Sugar Res. Center and Fac. of Agriculture, Kagawa Univ., Miki-cho, Kagawa 761-0795, JPN) ,  KAMITORI Shigehiro (Life Sci. Res. Center and Fac. of Medicine, Kagawa Univ., 1750-1, Ikenobe, Miki-cho, Kita-gun, Kagawa 761-0793, JPN)
資料名： Biochimica et Biophysica Acta  (Biochimica et Biophysica Acta)
巻： 1804  号： 6  ページ： 1359-1368  発行年： 2010年06月 
JST資料番号： B0207A  ISSN： 0005-2728  CODEN： BBBMBS  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： L-フコースイソメラーゼ(L-FI)として知られるD-アラビノースイソメラーゼ(D-AI)は,D-アラビノースのD-リブロースへの及びL-フコースのL-フクロースへのアルドース-ケトース異性化を触媒する。B.pallidus D-AIはD-アラビノース及びL-フコースに加えてD-アルトロースのD-プシコースへの異性化を触媒する。2-メチル-2,4-ペンタジオール,グリセロール及び阻害剤L-フシトールと複合体を形成したB.pallidus D-AIの3つのX線構造を,各々1.77,1.60及び2.60Å解像度で測定した。B.pallidus D-AIはホモ六量体を形成し,1つのサブユニットはほとんど等しいサイズの3ドメインを保持した。すなわち,2つのRossmann折畳みドメイン及び1つの(β/α)バレル折畳みドメインの疑似体である。触媒金属イオン(Mn²⁺)をGlu342,Asp366及びHis532で配位結合した活性部位において見い出し,追加の金属イオンをAsp453で配位結合した基質の通路のチャンネルで見い出した。X線構造により,触媒金属イオンで相互に向かい合うGlu342及びAsp366は,C2からC1及びO1からO2にプロトンを移動し,各々酸/塩基触媒として作用する大腸菌L-FIに加えてB.pallidus D-AIによるアルドース-ケトース異性化のエン-ジオールメカニズムを支持した。しかしながら,Asp366のイオン化状態を考慮すると,触媒反応は触媒金属イオンにより安定化される負電荷エンジオール酸中間体を通しておそらく生じた。大腸菌L-FLとの構造比較により,B.pallidus D-AIは「開口」と「閉鎖」型の間をおそらく相互転換すること,及びB.pallidus D-AIで見い出された追加の金属イオンはこのチャンネル領域の安定化を支援することを示唆した。Copyright 2010 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： *桿菌属 ,  *アルドース-ケトースイソメラーゼ ,  *X線構造解析 ,  *酵素基質複合体 ,  酵素阻害剤 ,  六量体 ,  配位結合 ,  アミノ酸残基 ,  活性部位 ,  大腸菌 ,  金属イオン ,  マンガン ,  種差 ,  触媒反応 ,  異性化 ,  脂肪族アルコール ,  ポリオール ,  ジオール
準シソーラス用語： *Bacillus pallidus ,  *D-アラビノースイソメラーゼ ,  L-フコースイソメラーゼ

分類 (2件)： 酵素一般  (EB09010D) ,  微生物の生化学  (EG03020N)

物質索引 (3件)： L-フシトール ,  グリセロール ,  2-メチル-2,4-ペンタンジオール

タイトルに関連する用語 (5件)： Bacillus ,  D-アラビノースイソメラーゼ ,  L-フシトール ,  複合体 ,  X線構造