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J-GLOBAL ID：201002284444923602   整理番号：10A0626639

転移交差飽和法の理論解析

Theoretical analyses of the transferred cross-saturation method

著者 (6件)： MATSUMOTO Masahiko (Graduate School of Pharmaceutical Sciences, The Univ. of Tokyo, 7-3-1 Hongo, Bunkyo-ku, Tokyo 113-0033, JPN) ,  MATSUMOTO Masahiko (Japan Biomedicinal Information Res. Center (JBIRC), Japan Biological Informatics Consortium (JBIC), 2-3-26 Aomi ...) ,  UEDA Takumi (Graduate School of Pharmaceutical Sciences, The Univ. of Tokyo, 7-3-1 Hongo, Bunkyo-ku, Tokyo 113-0033, JPN) ,  UEDA Takumi (Japan Biomedicinal Information Res. Center (JBIRC), Japan Biological Informatics Consortium (JBIC), 2-3-26 Aomi ...) ,  SHIMADA Ichio (Graduate School of Pharmaceutical Sciences, The Univ. of Tokyo, 7-3-1 Hongo, Bunkyo-ku, Tokyo 113-0033, JPN) ,  SHIMADA Ichio (Biological Information Res. Center (BIRC), National Inst. of Advanced Industrial Sci. and Technol. (AIST), 2-4-7 ...)
資料名： Journal of Magnetic Resonance  (Journal of Magnetic Resonance)
巻： 205  号： 1  ページ： 114-124  発行年： 2010年07月 
JST資料番号： D0079D  ISSN： 1090-7807  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 膜蛋白質などの大きな分子は様々な生物学的に重要な事象において重要な役割を果たす。大きな錯体中の蛋白質配位子の接触残留物の識別を可能にする転移交差飽和(TCS)法を開発した。しかし,TCS法の実験条件の合理的最適化は,観察したTCS効果に及ぼす各実験パラメータの影響に関する情報不足によって阻まれている。ここでは,(試料溶液にアイソトポマを積極的に入れた)TCS法の理論的説明を確立し,コンピュータソフトウェアを開発して数値シミュレーションを実行した。それらを用いて,観察TCS効果への各実験パラメータの影響をシミュレーションにより解析した。シミュレーション研究は,(i)溶媒中の陽子濃度が10~30%である,(ii)配位子の結合分画である大きいp_bが高飽和効率に好ましい,(iii)TCS法はk_off>0.1s^-1の系に適用可能である,(iv)k_off≧10s^-1では,p_b≧0.1が好ましい,(v)k_offが約1s^-1では,p_b≧0.5が好ましい,(vi)TCS法は大きなτ_c(約1μs)の系に適用可能である,ことを示した(p_bは約0.01)。モデルスピンシミュレーションにおける仮定を,ユビキチン-YUH1(酵母ユビキチンヒドロラーゼ1)相互作用を用いて実験的に確認した。確立方法は,TCS実験条件を評価し,最適化するのに役立つ。Copyright 2010 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： 飽和 ,  *解析 ,  交差 ,  膜タンパク質 ,  配位子 ,  接触 ,  残留物 ,  最適化 ,  条件 ,  アイソトポマ ,  ソフトウェア ,  シミュレーション ,  溶媒 ,  陽子 ,  濃度 ,  効率 ,  ユビキチン ,  相互作用 ,  *NMR【磁気共鳴】
準シソーラス用語： 実験条件 ,  数値シミュレーション ,  *転移交差飽和 ,  *理論解析

分類 (1件)： NMR一般  (BM07041R)

タイトルに関連する用語 (2件)： 転移交差飽和法 ,  理論解析