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J-GLOBAL ID：201002289901592023   整理番号：10A0378851

大規模な生体画像データセットを対象とするリアルタイムの三次元可視化および定量解析を可能とするV3D

V3D enables real-time 3D visualization and quantitative analysis of large-scale biological image data sets

著者 (5件)： PENG Hanchuan (Howard Hughes Medical Inst., Virginia, USA) ,  RUAN Zongcai (Howard Hughes Medical Inst., Virginia, USA) ,  LONG Fuhui (Howard Hughes Medical Inst., Virginia, USA) ,  SIMPSON Julie H (Howard Hughes Medical Inst., Virginia, USA) ,  MYERS Eugene W (Howard Hughes Medical Inst., Virginia, USA)
資料名： Nature Biotechnology  (Nature Biotechnology)
巻： 28  号： 4  ページ： 348-353  発行年： 2010年04月 
JST資料番号： H0870A  ISSN： 1087-0156  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： V3Dシステムは,ギガバイトサイズの顕微鏡画像スタックの三次元可視化を,一般のノート型およびデスクトップ型コンピューター上でリアルタイムに行う。V3Dでは,複雑な画像パターンのオンラインによる解析,測定,および校正を効率化するために,画像中の位置を三次元空間内で直接選択し,蛍光プローブなどによって得られる生物学的測定結果を重なり合った面オブジェクトで表示する人間工学的な機能を組み合わせている。V3Dは,あらゆる主要なコンピュータープラットフォーム上で動作し,特定の生物学的問題を解決するためのソフトウェア・プラグインによって機能を強化することができる。この拡張性を証明するため,我々は,V3Dベースのアプリケーション「V3D-Neuron」を作成し,高解像度の脳画像から複雑な三次元ニューロン構造を再構成した。V3D-Neuronは,ショウジョウバエ脳の1個のニューロンの形態を数分間で正確にデジタル化することができ,ほかのニューロン再構成ツールとの比較では,信頼性が約17倍に向上し,時間が1/10に短縮されている。V3D-Neuronを使用することで,ショウジョウバエ脳内の神経突起経路の三次元デジタルアトラス構築の実現可能性が実証された。Copyright Nature Publishing Group 2010

シソーラス用語： *計測システム ,  *画像処理システム ,  撮像 ,  可視化 ,  ショウジョウバエ ,  脳 ,  ニューロン ,  立体構造 ,  生体画像 ,  実時間処理
準シソーラス用語： *V3Dシステム ,  V3D-Neuron ,  *三次元可視化 ,  三次元構造 ,  定量解析

分類 (3件)： 生体の顕微鏡観察法  (EA03050C) ,  神経の基礎医学  (GN01020W) ,  医用画像処理  (JE04020T)

タイトルに関連する用語 (6件)： 大規模 ,  生体画像 ,  データセット ,  リアルタイム ,  三次元可視化 ,  定量解析