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J-GLOBAL ID：201102279568455325   整理番号：11A0123721

バクテリア細胞の表現型のランドスケープ

Phenotypic Landscape of a Bacterial Cell

著者 (18件)： NICHOLS Robert J. (Oral and Craniofacial Sciences Graduate Program, Univ. of California, San Francisco, 513 Parnassus Avenue, San ...) ,  NICHOLS Robert J. (Dep. of Microbiology and Immunology, Univ. of California, San Francisco, 600 16th Street, San Francisco, CA 94158, USA) ,  SEN Saunak (Dep. of Epidemiology and Biostatistics, Univ. of California, San Francisco, San Francisco, CA 94107, USA) ,  CHOO Yoe Jin (Dep. of Microbiology and Immunology, Univ. of California, San Francisco, 600 16th Street, San Francisco, CA 94158, USA) ,  BELTRAO Pedro (Dep. of Cellular and Molecular Pharmacology and The California Inst. for Quantitative Biomedical Res., Univ. of ...) ,  ZIETEK Matylda (Dep. of Microbiology and Immunology, Univ. of California, San Francisco, 600 16th Street, San Francisco, CA 94158, USA) ,  CHABA Rachna (Dep. of Microbiology and Immunology, Univ. of California, San Francisco, 600 16th Street, San Francisco, CA 94158, USA) ,  LEE Sueyoung (Dep. of Microbiology and Immunology, Univ. of California, San Francisco, 600 16th Street, San Francisco, CA 94158, USA) ,  KAZMIERCZAK Krystyna M. (Dep. of Biology, Indiana Univ., Bloomington, IN 47405, USA) ,  LEE Karis J. (Dep. of Microbiology and Immunology, Univ. of California, San Francisco, 600 16th Street, San Francisco, CA 94158, USA) ,  WONG Angela (Dep. of Microbiology and Immunology, Univ. of California, San Francisco, 600 16th Street, San Francisco, CA 94158, USA) ,  SHALES Michael (Dep. of Cellular and Molecular Pharmacology and The California Inst. for Quantitative Biomedical Res., Univ. of ...) ,  LOVETT Susan (Dep. of Biology and Rosenstiel Basic Medical Sciences Res. Center, Brandeis Univ., Waltham, MA 02454-9110, USA) ,  WINKLER Malcolm E. (Dep. of Biology, Indiana Univ., Bloomington, IN 47405, USA) ,  KROGAN Nevan J. (Dep. of Cellular and Molecular Pharmacology and The California Inst. for Quantitative Biomedical Res., Univ. of ...) ,  TYPAS Athanasios (Dep. of Microbiology and Immunology, Univ. of California, San Francisco, 600 16th Street, San Francisco, CA 94158, USA) ,  GROSS Carol A. (Dep. of Microbiology and Immunology, Univ. of California, San Francisco, 600 16th Street, San Francisco, CA 94158, USA) ,  GROSS Carol A. (Dep. of Cell and Tissue Biology, Univ. of California, San Francisco, San Francisco, CA 94158, USA)
資料名： Cell (Cambridge, Mass.)  (Cell (Cambridge, Mass.))
巻： 144  号： 1  ページ： 143-156  発行年： 2011年01月07日 
JST資料番号： A0707B  ISSN： 0092-8674  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： バクテリアにおける配列情報の急増により,表現型と遺伝子を一致させるための高処理かつ対費用効果の高いアプローチの開発が不可欠となっている。著者らは,原理の証明としてE.coliを用いて,大規模なケミカルゲノミクスと定量的適応度測定を組み合わせて,多くの発見のある高品質のデータセットを提示する。並行する数百の条件における変異体ライブラリーの増殖プロファイルの調査では>10,000表現型が得られ,これにより遺伝子不可欠性の調査,遺伝子機能および薬物作用の手掛かりの発見,およびバクテリア染色体の高次機構の理解が可能になった。著者らは,広範に使用される抗生物質併用療法,トリメトプリムおよびスルホンアミド間の多剤抗生物質耐性に関与する遺伝子への洞察,および相乗作用をはじめとして,本研究から得た新たな情報をハイライトする。このデータセットは,<http://ecoliwiki.net/tools/chemgen/>から入手可能であり,数百のアノテートされた遺伝子と特徴づけられていない遺伝子との間の高信頼性関連と同時に,十分に解明されていないさまざまな薬剤の作用機序に関する推測を提示することから,微生物学的コミュニティおよび生物情報学的コミュニティの両方において有用なリソースである。Copyright 2011 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： *大腸菌 ,  *表現型 ,  抗細菌薬 ,  サルファ剤 ,  遺伝子ライブラリー ,  *薬剤感受性 ,  遺伝子ターゲティング ,  欠失突然変異 ,  細菌 ,  窒素複素環化合物 ,  フェノールエーテル ,  アミノ酸 ,  芳香族アミン ,  芳香族カルボン酸 ,  カルボアミド ,  ヒドロキシ化合物 ,  ジカルボン酸 ,  第二アミン
準シソーラス用語： *大腸菌K12 ,  遺伝子ノックアウト法 ,  γプロテオバクテリア

分類 (4件)： 遺伝学研究法  (EC01020N) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  微生物生理一般  (EG03051L) ,  抗細菌薬の基礎研究  (GW17020S)

物質索引 (3件)： トリメトプリム ,  テトラヒドロ葉酸 ,  ジヒドロ葉酸

タイトルに関連する用語 (4件)： バクテリア ,  細胞 ,  表現型 ,  ランドスケープ