特許

J-GLOBAL ID：201103005556727576

一塩基多型を検出する方法および試薬キット

発明者： 中谷 和彦 ,  武井 史恵 ,  萩原 正規
出願人/特許権者： 国立大学法人大阪大学
代理人 (1件)： 特許業務法人原謙三国際特許事務所
公報種別：公開公報
出願番号（国際出願番号）：特願2010-054658
公開番号（公開出願番号）：特開2011-182763
出願日： 2010年03月11日
公開日（公表日）： 2011年09月22日
要約：

【課題】より信頼性のある検出結果を得ることができるSNPの検出方法、およびSNPを検出するための試薬キットを提供する。【解決手段】ヘアピンプライマーを含むプライマーセット、コンペティタープライマーを含むプライマーセット、バルジ構造結合分子および試料核酸、を用いて核酸増幅反応を行い、SNPを検出する方法であって、コンペティタープライマーは、ヘアピンプライマーの試料核酸に対して相補的な領域よりも、5’末端側に少なくとも1塩基長いものであるので、偽陽性の発生を抑制することができ、より信頼性の高い検出結果を得ることができる。【選択図】図2

請求項（抜粋）：

ヘアピンプライマーを含むプライマーセット、コンペティタープライマーを含むプライマーセット、バルジ構造結合分子および試料核酸、を用いて核酸増幅反応を行い、SNPを検出する方法であって、 該バルジ構造結合分子を用いて、該ヘアピンプライマーの量を測定する測定工程、を包含し、 該試料核酸には、野生型核酸および/または野生型核酸に対してSNPの位置において一塩基変異している変異型核酸が含まれ、 該ヘアピンプライマーは、該試料核酸に対して相補的な領域、および該領域の5’末端に結合された一本鎖DNA断片からなるものであって、 該一本鎖DNA断片は、ヘアピン構造を形成し、該ヘアピン構造中にバルジ構造を有するものであり、 該ヘアピンプライマーの3’末端の位置は、該試料核酸におけるSNPの位置になるように設計されており、 該コンペティタープライマーは、該ヘアピンプライマーの試料核酸に対して相補的な領域よりも、5’末端側に少なくとも1塩基長いものであり、該コンペティタープライマーの3’末端の位置は、該試料核酸におけるSNPの位置になるように設計されており、 (1)該ヘアピンプライマーにより、該野生型核酸の増幅を目的とする場合は、該コンペティタープライマーの3’末端は、該変異型核酸における該SNPの位置の塩基に相補的な塩基である、または、 (2)該ヘアピンプライマーにより、該変異型核酸の増幅を目的とする場合は、該コンペティタープライマーの3’末端は、該野生型核酸における該SNPの位置の塩基に相補的な塩基である ことを特徴とする方法。

IPC (2件)：

C12Q 1/68 ,  C12N 15/09

FI (2件)：

C12Q1/68 A ,  C12N15/00 A

Fターム (16件)：

4B024AA11 ,  4B024AA20 ,  4B024BA80 ,  4B024CA01 ,  4B024CA09 ,  4B024HA12 ,  4B063QA12 ,  4B063QA17 ,  4B063QQ12 ,  4B063QQ42 ,  4B063QQ58 ,  4B063QR08 ,  4B063QR32 ,  4B063QR55 ,  4B063QR62 ,  4B063QS34

引用特許：

審査官引用 (4件)

• バルジ塩基認識分子およびバルジ塩基検出方法
  公報種別：公開公報   出願番号：特願2003-054707   出願人：独立行政法人科学技術振興機構
• バルジ塩基検出分子
  公報種別：公開公報   出願番号：特願2002-061945   出願人：科学技術振興事業団
• グアニンバルジ修飾分子
  公報種別：公開公報   出願番号：特願2002-062883   出願人：科学技術振興事業団
• バルジ塩基認識分子及びそれを含有するDNA
  公報種別：公開公報   出願番号：特願平11-262205   出願人：科学技術振興事業団

引用文献：

審査官引用 (3件)

• F.Takei, et al., Chem Eur J, 2007, 13, pp4452-4457
• Z.Xi, et al., Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters, 2005, 15, pp2673-2677
• 武井史惠ら、日本化学会第88春季年会-講演予稿集II、平成20(2008)年3月12日、814頁、1