研究者
J-GLOBAL ID：201201071327312942   更新日: 2024年11月15日

内藤 雄樹

ナイトウ ユウキ | Naito Yuki
所属機関・部署：
東京科学大学 大学院医歯学総合研究科

東京科学大学 大学院医歯学総合研究科 について


職名： 特任准教授
ホームページURL (1件)： https://data.dbcls.jp/~meso/meme/
研究分野 (2件)： 分子生物学 ,  ゲノム生物学
研究キーワード (5件)： 核酸医薬 ,  ゲノム編集 ,  統合データベース ,  マイクロRNA ,  RNA干渉
競争的資金等の研究課題 (9件)：
  • 2019 - 2022 In vivoゲノム編集を利用した遺伝子治療用製品の安全性評価に関する研究
  • 2016 - 2019 ゲノム編集を利用した遺伝子治療用製品の安全性評価に関する研究
  • 2014 - 2016 トランスクリプトームを基盤とする統合遺伝子検索システムの構築
  • 2014 - 2015 統合遺伝子検索エンジンの開発
  • 2009 - 2012 マイクロRNAの発現・成熟に関わる分子の網羅的探索とその機能解析
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論文 (36件)：
  • Shuya Ikeda, Hiromasa Ono, Tazro Ohta, Hirokazu Chiba, Yuki Naito, Yuki Moriya, Shuichi Kawashima, Yasunori Yamamoto, Shinobu Okamoto, Susumu Goto, et al. TogoID: an exploratory ID converter to bridge biological datasets. Bioinformatics. 2022. 38. 17. 4194-4199
  • Tokuyuki Yoshida, Kunihiko Morihiro, Yuki Naito, Atsushi Mikami, Yuuya Kasahara, Takao Inoue, Satoshi Obika. Identification of nucleobase chemical modifications that reduce the hepatotoxicity of gapmer antisense oligonucleotides. Nucleic Acids Research. 2022. 50. 13. 7224-7234
  • Kazuaki Yamaguchi, Mitsutaka Kadota, Osamu Nishimura, Yuta Ohishi, Yuki Naito, Shigehiro Kuraku. Technical considerations in Hi-C scaffolding and evaluation of chromosome-scale genome assemblies. Molecular ecology. 2021. 30. 5923-5934
  • Kazuaki Yamaguchi, Mitsutaka Kadota, Osamu Nishimura, Yuta Ohishi, Yuki Naito, Shigehiro Kuraku. Practical guide for obtaining and validating chromosome-scale genome assemblies with Hi-C scaffolding. Authorea (preprint). 2021
  • BioHackathon 2015: Semantics of data for life sciences and reproducible research [version 1; peer review: awaiting peer review]. F1000Research. 2020
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MISC (4件)：
特許 (14件)：
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書籍 (13件)：
  • 完全版ゲノム編集実験スタンダード
    羊土社 2019 ISBN:9784758122443
  • なぜ、いま核酸医薬なのか : 次なる創薬モダリティの本命(実験医学2019年1月号)
    羊土社 2019 ISBN:9784758125154
  • 今日から使える! データベース・ウェブツール 達人になるための実践ガイド100(実験医学増刊)
    羊土社 2014 ISBN:4758103437
  • ゲノム編集法の新常識!CRISPR/Casが生命科学を加速する(実験医学2014年7月号)
    羊土社 2014 ISBN:4758101299
  • 新遺伝子工学ハンドブック(改訂第5版)
    羊土社 2010 ISBN:4758101779
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Works (9件)：
  • くすりのリスト: 医薬品の簡易検索サイト
    内藤 雄樹 2020 - 現在
  • CRISPRdirect: ゲノム編集のためのガイドRNA設計ウェブサーバ
    内藤 雄樹, 日野 公洋, 坊農 秀雅, 程 久美子 2014 - 現在
  • Probe Search《プププローブ》
    内藤 雄樹 2013 - 現在
  • GGGenome: 高速塩基配列検索ウェブサーバ
    内藤 雄樹, 坊農 秀雅 2012 - 現在
  • GGRNA: 遺伝子をGoogleのように検索できるウェブサーバ
    内藤 雄樹, 坊農 秀雅 2011 - 現在
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学歴 (2件)：
  • 2002 - 2007 東京大学 大学院理学系研究科 生物化学専攻
  • 1998 - 2002 東京大学 理学部 生物化学科
学位 (1件)：
  • 博士(理学) (東京大学)
経歴 (5件)：
  • 2024/10 - 現在 東京科学大学 大学院医歯学総合研究科 特任准教授
  • 2023/04 - 現在 ライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS) 客員准教授
  • 2023/04 - 2024/09 東京医科歯科大学 大学院医歯学総合研究科 特任准教授
  • 2011/04 - 2023/03 ライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS) 特任助教
  • 2007/04 - 2011/03 東京大学 大学院理学系研究科 生物化学専攻 助教
委員歴 (1件)：
  • 2018/03 - 現在 医薬品医療機器総合機構(PMDA) 専門委員
所属学会 (2件)：
日本核酸医薬学会(評議員・幹事) ,  日本分子生物学会
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