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J-GLOBAL ID：201202221739296610   整理番号：12A1459054

βグロビン遺伝子座における細胞型特異的染色体編制を通じたCTCFが仲介する転写調節

CTCF-mediated transcriptional regulation through cell type-specific chromosome organization in the β-globin locus

著者 (7件)： JUNIER Ivan (Univ. Evry, Evry) ,  JUNIER Ivan (Inst. Complex Systems, Paris, FRA) ,  JUNIER Ivan (Centre for Genomic Regulation, Barcelona, ESP) ,  DALE Ryan K. (National Inst. Health, MD, USA) ,  HOU Chunhui (National Inst. Health, MD, USA) ,  KEPES Francois (Univ. Evry, Evry) ,  DEAN Ann (National Inst. Health, MD, USA)
資料名： Nucleic Acids Research  (Nucleic Acids Research)
巻： 40  号： 16  ページ： 7718-7727  発行年： 2012年09月14日 
JST資料番号： D0242C  ISSN： 0305-1048  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 染色体立体構造捕捉(3C)法で決定したCCCTC結合インスレータータンパク質CTCFのループ化相互作用のクロマチンポリマーモデルへの統合により,ヒトβグロビン遺伝子を含む1Mbp領域の三次元折り畳みを調べた。赤血球でCTCFが仲介する細胞型特異的相互作用は,in vivoでβグロビン遺伝子座制御領域(LCR)と遺伝子間で起こることが知られている接触を支持するよう組織化された。またモデル化されたβグロビンドメインは,LCR及び周辺の活性なグロビン遺伝子と共に小球へと折り畳まれた。非赤血球細胞で,この小球は余り緻密ではなく,少数だが優勢なCTCF相互作用が遺伝子をLCRから離した。本結果はCTCFの接触全体が制御配列と標的遺伝子の間の空間的距離に影響し,転写に必要な染色体編制に寄与する事を示す。

シソーラス用語： 遠距離相互作用 ,  *遺伝的調節 ,  クロマチン ,  分子間相互作用 ,  折畳み構造 ,  グロビン ,  立体構造 ,  遺伝子座
準シソーラス用語： *転写調節 ,  *CTCF蛋白質 ,  β-グロビン ,  細胞型

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (7件)： βグロビン ,  遺伝子座 ,  細胞型 ,  染色体 ,  CTCF ,  仲介 ,  転写調節