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J-GLOBAL ID：201202224414452950   整理番号：12A1038417

ラマンスペクトルを利用する微生物種の分類化のためのスペクトル・シグネチャ

Spectral signatures for the classification of microbial species using Raman spectra

著者 (5件)： WEBB-ROBERTSON Bobbie-Jo M. (Pacific Northwest National Lab., 902 Battelle Blvd, J4-33, 99352, Richland, WA, USA) ,  BAILEY Vanessa L. (Pacific Northwest National Lab., 902 Battelle Blvd, J4-33, 99352, Richland, WA, USA) ,  FANSLER Sarah J. (Pacific Northwest National Lab., 902 Battelle Blvd, J4-33, 99352, Richland, WA, USA) ,  WILKINS Michael J. (Pacific Northwest National Lab., 902 Battelle Blvd, J4-33, 99352, Richland, WA, USA) ,  HESS Nancy J. (Pacific Northwest National Lab., 902 Battelle Blvd, J4-33, 99352, Richland, WA, USA)
資料名： Analytical & Bioanalytical Chemistry  (Analytical & Bioanalytical Chemistry)
巻： 404  号： 2  ページ： 563-572  発行年： 2012年08月 
JST資料番号： E0425B  ISSN： 1618-2642  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 共焦点ラマン顕微鏡法に基づく分類化法が,目標とする研究に重点が置かれ,スペクトル・ライブラリーが制御された装置パラメーターの下で収集され,これが,標準多変量データ解析と交差検証による解析を促進する。筆者らは,種々のスペクトル範囲で収集した分解能のレベルが変動するスペクトルを単一低次元スペクトル・シグネチャ・ライブラリーに変換する方法を開発して比較する。この方法が,異なる時間と条件で蓄積されたスペクトルを調整することが可能なロバストな解析法をもたらす。筆者らは,関連する試験事例,即ち,自然環境からの微生物種の同定にこれらの方法を示す。訓練データは2つの時間点で収集された3種の固有種に調製された試料に基づき,試験データは種々の装置パラメーターによって後日に得られたデータからなる。その結果は,スペクトル・シグネチャの縮小次元表現が基本的アラインメント・プロトコルによる分類精度を向上することを示唆する。特に,アラインメントに基づく盲検サンプルへの微生物種部分最小二乗法判別分析分類器が,~78%の精度を実現した一方,ビンニングとピーク選択法が100%の精度を与えた。Copyright 2012 Springer-Verlag (outside the USA) Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： *スペクトル解析 ,  *微生物 ,  *分類 ,  部分最小二乗法 ,  判別分析 ,  多変量解析 ,  交差検証法 ,  *顕微Raman分光法
準シソーラス用語： *共焦点Raman分光法

分類 (2件)： 生物物理的研究法  (EA03020V) ,  微生物形態学・分類学  (EG03030Y)

引用文献 (23件)：

• Nicolaou N, Xu Y, Goodacre R (2011) Fourier transform infrared and Raman spectroscopies for the rapid detection, enumeration, and growth interaction of the bacteria Staphylococcus aureus and Lactococcus lactis ssp. cremoris in milk. Anal Chem 83:5681-5687
• Pichardo-Molina JL, Frausto-Reyes C, Barbosa-Garcia O, Huerta-Franco R, Gonzalez-Trujillo JL, Ramirez-Alvarado CA, Gutierrez-Juarez G, Medina-Gutierrez C (2007) Raman spectroscopy and multivariate analysis of serum samples from breast cancer patients. Lasers Med Sci 22:229-236
• Teh SK, Zheng W, Ho KY, Teh M, Yeoh KG, Huang Z (2008) Diagnosis of gastric cancer using near-infrared Raman spectroscopy and classification and regression tree techniques. J Biomed Opt 13:034013
• Vargis E, Kanter EM, Majumder SK, Keller MD, Beaven RB, Rao GG, Mahadevan-Jansen A (2011) Effect of normal variations on disease classification of Raman spectra from cervical tissue. Analyst 136:2981-2987
• Widjaja E, Zheng W, Huang Z (2008) Classification of colonic tissues using near-infrared Raman spectroscopy and support vector machines. Int J Oncol 32:653-662

タイトルに関連する用語 (5件)： ラマンスペクトル ,  生物種 ,  分類 ,  スペクトル ,  シグネチャ