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J-GLOBAL ID：201202281023188860   整理番号：12A1219845

マルチスケールの自然運動は単一粒子電子顕微鏡投影画像を用い大分子の詳細を示す

Multiscale natural moves refine macromolecules using single-particle electron microscopy projection images

著者 (3件)： ZHANG Junjie (Stanford Univ. School of Medicine, CA) ,  MINARY Peter (Stanford Univ. School of Medicine, CA) ,  LEVITT Michael (Stanford Univ. School of Medicine, CA)
資料名： Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  (Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America)
巻： 109  号： 25  ページ： 9845-9850  発行年： 2012年06月19日 
JST資料番号： D0387A  ISSN： 0027-8424  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 2D電子顕微鏡投影は大分子立体配座の価値ある情報を含み,これらの2Dデータをコンピューターで解析し,柔軟性と異質性が明らかとなるが,2D画像の直接使用は多数の大分子自由度(DOF)に基づく過剰適合があるため検討されていない。今回,自然運動(NM)モンテカルロ(MC)法を利用し,マルチスケールで可動ループにより結合した少数のセグメントとして大分子をモデル化した。リゾチームシミュレーションデータを用い,最適な詳細プロトコルを確立した。本方法を古細菌Methonococcus maripaludisシャペロニン(Mm-cpn)に応用した。一つのクラス平均投影を用い,閉口状態から開口状態の最終モデルまでのその立体配座を定めた。また,NMを用い,開口と閉口状態混合下のMm-cpnの異質性投影画像を示した。本結果は立体配座的に柔軟性のある大分子に特に適切な電子顕微鏡的詳細を示す一般的方法を示唆した。

シソーラス用語： *電子顕微鏡観察 ,  高分子 ,  *モンテカルロ法 ,  リゾチーム ,  シミュレーション ,  古細菌 ,  *シャペロンタンパク質 ,  立体配座 ,  柔軟性 ,  最適化
準シソーラス用語： *シャペロニン ,  マルチスケール解析 ,  単一粒子 ,  *Markov連鎖モンテカルロ法 ,  確率的最適化

分類 (2件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  生体の顕微鏡観察法  (EA03050C)

タイトルに関連する用語 (6件)： マルチスケール ,  運動 ,  単一粒子 ,  電子顕微鏡 ,  投影画像 ,  分子