粕川雄也

Kasukawa Takeya

所属機関・部署：
職名：チームリーダー
その他の所属（所属・部署名・職名） (2件)：

研究分野 (2件)：データベース , システムゲノム科学

研究キーワード (6件)：マイクロアレイ , RNA-Seq , トランスクリプトーム , ゲノム , データベース , バイオインフォマティクス

競争的資金等の研究課題 (3件)：

論文 (100件)：

Nejc Haberman, Holly Digby, Rupert Faraway, Rebecca Cheung, Anob M. Chakrabarti, Andrew M. Jobbins, Callum Parr, Kayoko Yasuzawa, Takeya Kasukawa, Chi Wai Yip, et al. Widespread 3′UTR capped RNAs derive from G-rich regions in proximity to AGO2 binding sites. BMC Biology. 2024. 22. 1
Saumya Agrawal, Andrey Buyan, Jessica Severin, Masaru Koido, Tanvir Alam, Imad Abugessaisa, Howard Y. Chang, Josée Dostie, Masayoshi Itoh, Juha Kere, et al. Annotation of nuclear lncRNAs based on chromatin interactions. PLOS ONE. 2024. 19. 5. e0295971-e0295971
Imad Abugessaisa, Ri-Ichiroh Manabe, Tsugumi Kawashima, Michihira Tagami, Chitose Takahashi, Yasushi Okazaki, Stefania Bandinelli, Takeya Kasukawa, Luigi Ferrucci. OVCH1 Antisense RNA 1 is differentially expressed between non-frail and frail old adults. GeroScience. 2024. 46. 2. 2063-2081
Takuya Kuroda, Satoshi Yasuda, Satoko Matsuyama, Takumi Miura, Rumi Sawada, Akifumi Matsuyama, Yumiko Yamamoto, Masaki Suimye Morioka, Hideya Kawaji, Takeya Kasukawa, et al. ROR2 expression predicts human induced pluripotent stem cell differentiation into neural stem/progenitor cells and GABAergic neurons. Scientific reports. 2024. 14. 1. 690-690
Jonathan Moody, Tsukasa Kouno, Miki Kojima, Ikuko Koya, Julio Leon, Akari Suzuki, Akira Hasegawa, Taishin Akiyama, Nobuko Akiyama, Masayuki Amagai, et al. A single-cell atlas of transcribedcis-regulatory elements in the human genome. 2023

MISC (23件)：

Abugessaisa I, Noguchi S, Carninci P, Kasukawa T. The FANTOM5 Computation Ecosystem: Genomic Information Hub for Promoters and Active Enhancers. Methods in molecular biology (Clifton, N.J.). 2017. 1611. 199-217
T. Kasukawa, M. Lizio, J. Harshbarger, S. Hisashi, J. Severin, A. Imad, S. Sahin, T. C. Freeman, K. Baillie, A. Sandelin, et al. FANTOM5 web resource for the large-scale genome-wide transcription start site activity profiles of wide-range of mammalian cells. HUMAN GENOMICS. 2016. 10
粕川雄也, 杉本昌弘, 肥田昌子, 南陽一, 森雅代, 本間さと, 本間研一, 三島和夫, 曽我朋義, 上田泰己. 睡眠基礎研究の萌芽的シンポジウムヒト血液代謝産物を用いた2時点の血液サンプルによる体内時刻測定法. 日本睡眠学会定期学術集会プログラム・抄録集. 2013. 38回. 111-111
粕川雄也, 杉本昌弘, 肥田昌子, 南陽一, 森雅代, 本間さと, 本間研一, 三島和夫, 曽我朋義, 上田泰己. ヒト血液代謝産物を用いた分子時刻表法による簡便なヒト体内時計の同定方法. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2012. 35th. WEB ONLY 2W1I-8
鵜飼-蓼沼磨貴, 粕川雄也, 上田泰己. 哺乳類概日時計の転写ネットワークの物理的シミュレーション (特集生命システムの階層間をまたぐイメージング技術). 蛋白質核酸酵素. 2009. 54. 15. 1958-1964

特許 (1件)：

書籍 (7件)：

時間薬理学による最新の治療戦略
医薬ジャーナル社 2013 ISBN:4753226042
体内時計の科学と産業応用 (バイオテクノロジーシリーズ)
シーエムシー出版 2011 ISBN:4781303404
改訂第2版バイオデータベースとウェブツールの手とり足とり活用法 - 遺伝子の配列・機能解析、タンパク質解析、プロテオミクス、文献検索、検索エンジン...etc.真に役立つサイトを使い倒す!
羊土社 2007 ISBN:4758108110
RとBioconductorを用いたバイオインフォマティクス
シュプリンガー・ジャパン株式会社 2007 ISBN:4431734643
バイオインフォマティクスゲノム配列から機能解析へ第2版
メディカル・サイエンス・インターナショナル 2005 ISBN:4895924262

講演・口頭発表等 (1件)：

学位 (1件)：

経歴 (8件)：

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所属学会 (4件)：

電子情報通信学会 , 情報処理学会 , 日本バイオインフォマティクス学会 , 日本分子生物学会

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粕川 雄也