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J-GLOBAL ID：201302203418715815   整理番号：13A0016673

アルファ/ベータ-ヒドロラーゼ折畳み酵素のバイオインフォマティクス解析は,アミダーゼとリパーゼ活性の区別に関与するサブファミリー特異的部位を明らかにする

Bioinformatic analysis of alpha/beta-hydrolase fold enzymes reveals subfamily-specific positions responsible for discrimination of amidase and lipase activities

著者 (4件)： SUPLATOV D. A. (Lomonosov Moscow State Univ., Moscow, RUS) ,  BESENMATTER W. (Novozymes A/S, Bagsvaerd, DNK) ,  SVEDAS V. K. (Lomonosov Moscow State Univ., Moscow, RUS) ,  SVENDSEN A. (Novozymes A/S, Bagsvaerd, DNK)
資料名： Protein Engineering Design & Selection  (Protein Engineering Design & Selection)
巻： 25  号： 11-12  ページ： 689-697  発行年： 2012年11月 
JST資料番号： T0854A  ISSN： 1741-0126  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： α/βヒドロラーゼ折畳みスーパーファミリーは,機能的に多様化した大きなグループの一つで,それらの同族のメンバーは異なる反応を触媒するが,保存された構造と共通の触媒機械を共有する。本研究で,リパーゼとペプチダーゼ活性に対応する活性部位における差異を同定するためにα/βヒドロラーゼの比較バイオインフォマティクス解析を使用した。リパーゼとペプチダーゼのサブファミリー内で保存されているが両者間では異なる,サブファミリー特異的部位は進化的に柔軟で多様であり,同族間の機能的区別に関与すると思われた。それ故,同定された部位はCandida antarcticaリパーゼBの無差別なアミダーゼ活性の改良のためのホットスポットとして使用された。変異体のin silicoライブラリーを構築し,2-クロロ-N-ベンジルアセトアミドの結合を評価するために分子モデルを使用した。

シソーラス用語： *ヒドロラーゼ ,  *情報科学 ,  *生物学 ,  *活性部位 ,  リパーゼ ,  アミダーゼ ,  分子モデル ,  突然変異体 ,  アミノ酸残基 ,  計算機シミュレーション ,  分子動力学
準シソーラス用語： *バイオインフォマティクス ,  リパーゼB ,  *触媒活性部位 ,  分子動力学シミュレーション

分類 (2件)： 酵素生理  (EG03052C) ,  分子構造  (EB03020Y)

物質索引 (1件)： 2-クロロ-N-ベンジルアセトアミド

タイトルに関連する用語 (8件)： ヒドロラーゼ ,  折畳み ,  酵素 ,  バイオインフォマティクス解析 ,  アミダーゼ ,  リパーゼ活性 ,  サブ ,  ファミリー