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J-GLOBAL ID：201302259165993754   整理番号：13A0254592

H1Rの結晶構造に基づくヒスタミンH4RのドッキングおよびMD研究

Docking and MD study of histamine H4R based on the crystal structure of H1R

著者 (3件)： FENG Zhiwei (Inst. of Functional Nano & Soft Materials (FUNSOM) and Jiangsu Key Lab. for Carbon-Based Functional Materials & ...) ,  HOU Tingjun (Inst. of Functional Nano & Soft Materials (FUNSOM) and Jiangsu Key Lab. for Carbon-Based Functional Materials & ...) ,  LI Youyong (Inst. of Functional Nano & Soft Materials (FUNSOM) and Jiangsu Key Lab. for Carbon-Based Functional Materials & ...)
資料名： Journal of Molecular Graphics & Modelling  (Journal of Molecular Graphics & Modelling)
巻： 39  ページ： 1-12  発行年： 2013年02月 
JST資料番号： B0044D  ISSN： 1093-3263  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ヒスタミン受容体H4RはG蛋白質結合受容体GPCRのクラスAに属し,マスト細胞および好酸球のヒスタミン誘起走化性に重要である。最近報告されたH1Rの結晶構造に基づいてH4RおよびH3Rのホモロジモデルを導いた。クロベンプロピットのH4R結合における2種の結合モードを識別した。一連の作用薬および拮抗剤との比較からプロトン化NHとAsp^3.32およびイミダゾールNHとGlu^5.46の相互作用を含む結合モード(A)を選定した。H4RとH3Rの比較からH4RのGlu^5.20およびThr^6.55が選択性に重要と考えた。分子動力学シミュレーションの結果もA錯体の安定性を支持した。ヒスタミンとH1R,H4Rのドッキングおよび錯体の分子動力学シミュレーションからいずれも結合によるTM5,TM6,TM7立体配座の顕著な変化(TM6内部構造の外部移動,Tyr^7.53の立体配座変化)を示し,活性GPCR結晶構造の最近の報告と一致した。H4Rの選択性および活性化機構は作用薬および抗体開発に有用であることを強調した。Copyright 2013 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： *ヒスタミン受容体 ,  膜受容体 ,  肥満細胞 ,  好酸球 ,  走化性 ,  結晶構造 ,  *ホモロジー ,  分子モデル ,  分子構造 ,  薬物 ,  分子間相互作用 ,  選択性 ,  分子認識 ,  *分子化合物 ,  錯体生成 ,  基質特異性 ,  計算機シミュレーション ,  安定性 ,  立体配座 ,  反応機構 ,  *ドッキング ,  活性部位
準シソーラス用語： G蛋白質結合受容体 ,  ホモロジーモデリング ,  マスト細胞 ,  作用薬 ,  分子動力学シミュレーション ,  拮抗剤

分類 (4件)： ヒスタミン薬・抗ヒスタミン薬の基礎研究  (GW06010V) ,  細胞膜の受容体  (EF04030C) ,  分子化合物  (CE02000C) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

物質索引 (1件)： クロベンプロピット

タイトルに関連する用語 (5件)： 結晶構造 ,  ヒスタミン ,  ドッキング ,  Md ,  研究