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J-GLOBAL ID：201302283456408512   整理番号：13A0832397

Trichinella spiralisのβチューブリンに対するベンズイミダゾールの結合サイトの同定を目指して 計算機および実験データからの考察

Towards the identification of the binding site of benzimidazoles to β-tubulin of Trichinella spiralis: Insights from computational and experimental data

著者 (7件)： AGUAYO-ORTIZ Rodrigo (Facultad de Quimica, Departamento de Farmacia, Universidad Nacional Autonoma de Mexico, Mexico, DF 04510, MEX) ,  MENDEZ-LUCIO Oscar (Facultad de Quimica, Departamento de Farmacia, Universidad Nacional Autonoma de Mexico, Mexico, DF 04510, MEX) ,  MEDINA-FRANCO Jose L. (Instituto de Quimica, Universidad Nacional Autonoma de Mexico, Mexico, DF 04510, MEX) ,  CASTILLO Rafael (Facultad de Quimica, Departamento de Farmacia, Universidad Nacional Autonoma de Mexico, Mexico, DF 04510, MEX) ,  YEPEZ-MULIA Lilian (Unidad de Investigacion Medica en Enfermedades Infecciosas y Parasitarias, IMSS, Mexico, DF 06720, MEX) ,  HERNANDEZ-LUIS Francisco (Facultad de Quimica, Departamento de Farmacia, Universidad Nacional Autonoma de Mexico, Mexico, DF 04510, MEX) ,  HERNANDEZ-CAMPOS Alicia (Facultad de Quimica, Departamento de Farmacia, Universidad Nacional Autonoma de Mexico, Mexico, DF 04510, MEX)
資料名： Journal of Molecular Graphics & Modelling  (Journal of Molecular Graphics & Modelling)
巻： 41  ページ： 12-19  発行年： 2013年04月 
JST資料番号： B0044D  ISSN： 1093-3263  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ベンズイミダゾール-2-カーバメート誘導体(BzC)は線虫疾患の治療においてもっとも重要な広いスペクトラムをもつ駆虫薬である。BzCはβチューブリンモノマに選択的に結合してミクロチューブ重合を阻害する。しかしネマトーダチューブリンの結晶構造および作用機構は未解明である。また,作用機構とBzCの結合サイトとの関係は明確に説明されていない。Trichinella spiralisのβチューブリンのアミノ酸配列に基づいてホモロジモデリングにより本蛋白質の3D構造を構築した。本モデルを用いる分子ドッキングおよび分子動力学シミュレーション計算によりBzC結合サイトを検討した。もっとも一般的な薬物抵抗性のアミノ酸突然変異体(F167Y,E198A,F200Y)およびチューブリンに対するコルヒチンの結合阻害の実験結果とよい一致を得た。Glu198,Thr165,Cys239,Gln134は水素結合生成においてBzCと直接相互作用し,結合プロセスにおいて重要なアミノ酸であることを見出した。本報の結果は駆虫薬の作用機構の分子レベル理解への一歩であり,より薬効に優れ高選択性の分子の設計に有用な情報を与える。Copyright 2013 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： *窒素複素環化合物 ,  *芳香族縮合化合物 ,  *カーバメート系殺虫剤 ,  線虫類 ,  *センモウチュウ ,  *チューブリン ,  結晶構造 ,  作用機序 ,  薬理作用 ,  活性部位 ,  アミノ酸配列 ,  *分子モデル ,  *分子構造 ,  三次元 ,  タンパク質 ,  *ドッキング ,  計算機シミュレーション ,  薬物耐性 ,  突然変異体 ,  薬物 ,  水素結合 ,  分子間相互作用 ,  分子化合物 ,  錯体生成 ,  スルフィド ,  カルバミド酸エステル ,  スルホキシド ,  脂環式化合物 ,  脂肪酸 ,  エノールエーテル ,  カルボアミド ,  フェノールエーテル ,  エノン ,  側鎖アミンアルカロイド ,  芳香族ケトン ,  硫黄複素環化合物
準シソーラス用語： *Trichinella spiralis ,  *βチューブリン ,  *ホモロジーモデリング ,  作用機構 ,  阻害剤 ,  分子動力学シミュレーション ,  薬物抵抗性 ,  ベンズイミダゾール誘導体

分類 (4件)： 抗原虫薬・駆虫薬の基礎研究  (GW17080G) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  分子化合物  (CE02000C) ,  分子構造  (EB03020Y)

物質索引 (11件)： アルベンダゾール ,  オキシベンダゾール ,  オクスフェンダゾール ,  カルベンダジム ,  コルヒチン ,  ノコダゾール ,  パルベンダゾール ,  フェンベンダゾール ,  メベンダゾール ,  リコベンダゾール ,  ルクサベンダゾール

タイトルに関連する用語 (7件)： Trichinella ,  βチューブリン ,  ベンズイミダゾール ,  結合サイト ,  同定 ,  計算機 ,  実験データ