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J-GLOBAL ID：201302294559962480   整理番号：13A1317738

TASUKE:大規模リシーケンスデータ解析のためのウェブ上可視化プログラム

TASUKE: a web-based visualization program for large-scale resequencing data

著者 (5件)： KUMAGAI Masahiko (National Inst. Agrobiological Sci., Ibaraki, JPN) ,  KIM Jungsok (National Inst. Agrobiological Sci., Ibaraki, JPN) ,  ITOH Ryutaro (National Inst. Agrobiological Sci., Ibaraki, JPN) ,  ITOH Ryutaro (DYNACOM Co., Ltd., Chiba, JPN) ,  ITOH Takeshi (National Inst. Agrobiological Sci., Ibaraki, JPN)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 29  号： 14  ページ： 1806-1808  発行年： 2013年07月15日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： TASUKEは,次世代シーケンシング技術によって生成された大規模なリシーケンスデータを可視化し,Web上で公開するためのWebアプリケーションである。複数のゲノムにおける配列変異とリードの深さ,およびアノテーション情報を様々なスケールで同時に表示することができる。50のイネゲノムと,100ヒトゲノムのリシーケンスデータに適用した。実装プログラムのパッケージとユーザーマニュアルはhttp://tasuke.dna.affrc.go.jp/から入手可能。

シソーラス用語： 可視化 ,  自動分析計 ,  *応用プログラム ,  アノテーション ,  *ゲノム ,  ヌクレオチド配列 ,  次世代シーケンサー ,  遺伝的変異 ,  *Webアプリケーション
準シソーラス用語： 変異 ,  *Webアプリケーションソフト

分類 (1件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (4件)： 大規模 ,  解析 ,  ウェブ ,  可視化