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J-GLOBAL ID：201402257995316750   整理番号：14A1489763

G蛋白質共役受容体の熱安定化突然変異のための迅速な計算予測

Rapid Computational Prediction of Thermostabilizing Mutations for G Protein-Coupled Receptors

著者 (5件)： BHATTACHARYA Supriyo (Beckman Res. Inst. of the City of Hope, California, USA) ,  LEE Sangbae (Beckman Res. Inst. of the City of Hope, California, USA) ,  GRISSHAMMER Reinhard (National Inst. of Health, Maryland, USA) ,  TATE Christopher G. (MRC Lab. of Molecular Biology, Cambridge, GBR) ,  VAIDEHI Nagarajan (Beckman Res. Inst. of the City of Hope, California, USA)
資料名： Journal of Chemical Theory and Computation  (Journal of Chemical Theory and Computation)
巻： 10  号： 11  ページ： 5149-5160  発行年： 2014年11月 
JST資料番号： W2328A  ISSN： 1549-9618  CODEN： JCTCCE  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： G蛋白質共役受容体(GPCR)への単一Ala点変異の導入による熱安定性受容体作出を目指し,構造探索のための計算法LITiConを拡張した迅速スクリーニング計算法LITiConDesigを開発した。膜貫通(TM)残基に対する系統的なAlaコンピュータースキャニングを受容体構造アンサンブルで行った。全原子力場エネルギー関数から計算した捻れエネルギーとファンデルワールス(vdW)パッキングエネルギーの合計により変異体安定性をスコアリングした。GPCRに属する3つのβ₁-アドレナリン受容体(β₁AR),アデノシンA_2A受容体(A_2AR)とニューロテンシン受容体1(NTSR1)に対して様々な精度を持つ約400変異のホモロジーモデルを用いてこの予測法を評価した。TMドメインの疎水性残基のAlaへの点変異が,実験で得た高い熱安定性と関連することを示した。立体構造のアンサンブルを用いた場合に単一構造より安定性スコアによる予測が改善され,受容体の柔軟性が重要であることを見出した。この方法は予測した変異体の上位35%で最も安定な熱安定性変異体を同定した。

シソーラス用語： 部位特異的変異誘発 ,  *点突然変異 ,  熱安定化 ,  *膜貫通タンパク質 ,  *β1受容体 ,  *A2受容体 ,  *情報伝達受容体 ,  *熱安定性 ,  アミノ酸残基 ,  数値計算 ,  エンタルピー ,  予測技法 ,  アミノ酸 ,  脂肪族アミン ,  脂肪族カルボン酸 ,  第一アミン
準シソーラス用語： *A2A受容体 ,  *G蛋白質共役受容体 ,  ニューロテンシン受容体1 ,  疎水性アミノ酸 ,  *膜貫通ドメイン

分類 (2件)： 細胞膜の受容体  (EF04030C) ,  数値計算  (JE02000J)

物質索引 (1件)： アラニン

タイトルに関連する用語 (5件)： G蛋白質共役受容体 ,  熱安定化 ,  突然変異 ,  計算 ,  予測